Postdoctoral fellowship: Condensate-mediated amyloid nucleation

Särskild ämnesbeskrivning

Amyloidaggregat i hjärnan påträffas vid neurodegenerativa sjukdomar som Parkinsons (PD) och Alzheimers sjukdomar (AD). De bakomliggande molekylära mekanismerna för utvecklingen av dessa sjukdomar är inte kända, även om de inblandade biomolekylerna har identifierats. De frågor som behandlas i detta projekt är 1) om och i vilken utsträckning kondensatbildning (även kallad vätske-vätskefas-separation) förstärker amyloidnukleation? och 2) vad är den molekylära grunden för sådan förstärkning? Ett särskilt fokus kommer att ligga på peptidstrukturen vid gränsytan mellan kondensatet och den omgivande vätskan. Orienteras amyloidpeptiderna vid gränsytan, och påverkar i så fall orienteringen nukleeringprocessen och dess hastighet? Vilka lösningsförhållanden främjar respektive kondensatbildning och amyloidbildning. Var är gränserna i fasdiagrammet? Vad är den molekylära mekanismen som gör att tillsats av olika molekyler eller ändringar i fysikaliska förhållanden kan störa systemet för att förstärka eller undertrycka nukleering? Projektet kommer att inkludera en rad olika metoder såsom uttryck och rening av  protein, optisk och elektronmikroskopi, fluorescens, cirkulär och linjär dikroismspektroskopi, fluorescenspolarisering, mikrofluidiska metoder, NMR-spektroskopi, etc.

Forskningen bedrivs inom Excellenscenter COMMONS (www.physchem.lu.se/commons). Centrets tema är ”Gemensamma drag i membrannära molekylära interaktioner”. Centrets övergripande mål är att skapa en mångfacetterad vetenskaplig miljö inom forskning som rör fysikalisk-kemiska processer i membransystem, och dess betydelse i cellulära membran och dess funktioner. Centrat bryggar mellan metodologisk och teoretisk expertis inom detta breda forskningsområde och inkluderar forskare från Lunds universitet, Chalmers och Köpenhamns universitet. Inom centret arrangeras även en forskarskola och ett internationellt gästprofessorprogram.

Den postdoktorala forskaren kommer att kunna utveckla sina vetenskapliga färdigheter och kunskaper inom det tvärvetenskapliga centret, vilket också kommer att påverka resultaten från forskningsprojekten. COMMONS leds av en grupp forskare från de deltagande universiteten (Emma Sparr, Sara Linse, Fredrik Höök, Martin Malmsten) som tillsammans med ytterligare forskare och gästprofessorer inom COMMONS kommer att vägleda projekten och handleda de rekryterade postdoktorerna mot akademiska eller industriella forskarbefattningar.

Denna postdoktorala tjänst är även en del av EU:s samfinansierade forskningsprojekt AMBER, Advanced Multiscale Biological imaging using European Research infrastructures, som kommer att fylla vetenskapliga och sektoriella luckor i biologisk avbildning från molekylär, via cellulär, till vävnad, organ och organism nivåer av organisation, och samordnas av LINXS, Lund Institute of advanced Neutron and X-ray Science.AMBER finansieras av EU:s Marie Skłodowska-Curie (MSCA) COFUND-program.Cirka 15 postdoktorer kommer att rekryteras i den andra utlysningen 2024, och varje anställning varar i 36 månader.

AMBER har sex kärnpartner: Lunds universitet/MAX IV, Sverige, European Spallation Source (ESS), Sverige, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Institut Laue-Langevin (ILL), Frankrike, International Institute of Molecular Mechanisms and Machines, (IMOL), Polen, och Leicester Institute of Structural and Chemical Biology, Storbritannien.

Ditt arbete kommer att omfatta biomedicinsk och biofysikalisk forskning. Det kommer också att omfatta teknikutvecklingsarbete som syftar till att kombinera avbildningstekniker och dataanalys för att ge en mer integrerad bild av livsprocesser i samband med hälsa och sjukdom. Du får som postdoktor inom AMBER-programmet stora medicinska, biologiska och metodologiska möjligheter, med en djupgående potentiell inverkan på Europas nästa generation av forskning och forskare. När du har avslutat AMBER-programmet kommer du att vara utomordentligt väl rustad för att fortsätta din karriär inom den akademiska världen, vid infrastrukturer, inom hälso- och MedTech-sektorerna och därefter.

För mer information om de totalt utlysta postdoktorala tjänsterna inom samfinansieringsprojektet AMBER, besök:

https://www.euraxess.se/jobs/231943

Intervjuerna kommer att inledas i november. För mer information om AMBER, ansöknings- och utvärderingsprocessen etc., besök:

https://www.ambercofund.eu

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Du kommer att utföra forskning inom det projektet som beskrivits ovan. Du kommer också att bidra till utvecklingen av de bredare tematiska områdena och samarbeta med flera medlemmar i COMMONS Center. Forskningen är huvudsakligen experimentell och kommer att genomföras i en miljö som erbjuder tillgång till instrument för toppmoderna metoder, inklusive optisk spektroskopi, spridningstekniker, yttekniker, avancerad optisk mikroskopi och elektronmikroskopi.

Den huvudsakliga arbetsuppgiften för tjänsten är genomförande av den forskningen som beskrivs ovan. Ytterligare arbetsuppgifter inkluderar:

• Koordinering av samarbete med internationella partner inom ämnesområdet
• Deltagande i handledning av examensstudenter och doktorander inom COMMONS forskarskola

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde.

Minimikraven är följande:

• Kandidaten måste ha högst 8 år efter en doktorsexamen (PhD), enligt kommissionens krav, i enlighet med Horizon-Europe MSCA cofund project Grant Agreement
• Bakgrund inom relevanta metoder,
• Ett fullständigt ansökningspaket som lämnas in via AMBER-portalen (inklusive meritförteckning och detaljerad forskningsplan), och slutligen
• Strikt efterlevnad av MSCA:s rörlighetsregel om att forskaren inte får ha varit bosatt eller bedrivit sin huvudsakliga verksamhet (arbete, studier osv.) i värdorganisationens land mer än tolv månader under de tre år som omedelbart föregår sista ansökningsdag.

Varje projekt har ytterligare särskilda krav som de sökande måste uppfylla. Kontrollera vilka dessa krav är innan du ansöker.

Övriga krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Stark dokumenterad erfarenhet av experimentella studier av mjuka material, inklusive biomolekylära system.
• Praktisk erfarenhet av forskning inom biofysik, fysikalisk kemi eller motsvarande.
• Ha varit medförfattare till flera publikationer i internationella tidskrifter med peer review granskning, varav minst två som huvudförfattare.

Bedömningsgrunder

Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

• Erfarenhet av experimentella metoder för att undersöka biomolekylär självorganisering vid ytor eller i lösningar, inklusive flera av följande: optisk superupplöst mikroskopi, single-molecule fluorescenstekniker, elektronmikroskopi, fluorescensspektroskopi, cirkulär och linjär dikroism, fluorescenspolarisering, NMR-spektroskopi, ytmetoder, titrerkalorimetri, skanningkalorimetri, mikrofluidiska metoder för diffusion, eller droppbaserade metoder.
• Erfarenhet av utveckling av experimentell metodik för ökad fysikalisk-kemisk förståelse av molekylära system.
• Erfarenhet av proteinuttryck och rening eller tekniker för membranpreparation.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max 3 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Instruktioner för ansökan

Mer information och dokument/mallar/länk till europass finns på:

https://www.ambercofund.eu/for-applicants

Ofullständiga ansökningar kommer inte att beaktas. Kom ihåg att ladda upp alla efterfrågade dokument, i-ix.

Om du är intresserad av att söka mer än en tjänst (högst 3) måste du vara beredd att lämna in en fullständig ansökan för varje enskild tjänst.

Ansökan ska skrivas på engelska och sammanställas i en PDF-fil som innehåller:

i) En meritförteckning (europassformat). Detta skapas genom att du registrerar dig och använder Europass-portalen. Din meritförteckning kan sedan exporteras till en PDF-fil som du använder i din ansökan.

ii) En detaljerad forskningsplan som omfattar alla planerade utstationeringar (sökande kan föreslå fler än den obligatoriska, de kan också föreslå sina egna utstationeringar), skolor och konferenser samt en mall för budgetplan. Forskningsplanen ska vara så kortfattad som möjligt, rekommenderat ca 3-5 sidor, men absolut maximalt 10 sidor. Forskningsplanen bör innehålla en halv sida med sammanfattning/abstract.

Ytterligare texter att inkludera i PDF-filen är:

iii) Åtagandeförklaring från eventuella ytterligare partners som den sökande vill knyta till sig.

iv) Bevis på kunskaper i engelska (minst CEFR B22, kontrolleras även vid intervjun).

v) Ett utkast till individuell karriärutvecklingsplan (ICDP).

vi) Två referensbrev.

vii) Eventuella ytterligare dokument till stöd för ansökan.

viii) Etiskt frågeformulär (checklista för etik inom högre utbildning + forskningsetiskt åtagande)

Dessutom kommer ansökan att kräva:

ix) Varje kandidat kan ansöka om högst 3 tjänster. Du måste ansöka för varje enskild tjänst. En lista med preferensordning för tjänsterna ska skickas till AMBER-ledningen. amber@linxs.se