Doktorand i funktionell bröstcancergenomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Forskargruppen för funktionell bröstcancergenomik
Tekniken för storskalig sekvensering har revolutionerat cancerforskningen och har underlättat kartläggningen av ett stort antal onkogener och tumörsuppressorgener. I kliniken används sekvensering idag bland annat vid utredning av misstänkt ärftlig cancer och för att identifiera mutationer som kan föranleda behandling med vissa målstyrda läkemedel. Inom forskargruppen för Funktionell bröstcancergenomik studerar vi hur genetisk variation och mutationer styr vilka gener och proteiner som uttrycks. Vi undersöker också hur detta påverkar risken för att utveckla bröstcancer och cancercellernas fenotyp. Forskargruppen, som är placerad på Medicon Village i Lund, söker nu en doktorand för forskarutbildning inom projekt "Functional synonymous variants and variants in splicing regulatory regions in breast cancer". Anställningen är på heltid under fyra år. Föreslaget tillträdesdatum är den 1 juli 2023 eller enligt överenskommelse. 

På Avdelningen för onkologi vid Medicon Village finns ett flertal forskargrupper som arbetar med olika tumörsjukdomar och avdelningen har länge varit framstående inom cancergenomik. Tillsammans med den samlokaliserade Avdelningen för translationell cancergenomik och Lunds universitets cancercentrum (LUCC) skapar vi en aktiv forskningsmiljö med seminarier, journal clubs, kurser och posterkvällar.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss

Arbetsuppgifter

Syftet med projektet är att förstå hur vissa typer av genetiska varianter, som hittills inte har studerats i större utsträckning, kan påverka bröstcancerrisk och tumöregenskaper genom effekter på cancercellernas transkriptom och proteom. Detta omfattar både varianter som kan påverka splicing av mRNA och synonyma varianter som vi studerar inom ärftlig och sporadisk bröstcancer.

Vi söker en välorganiserad och ambitiös doktorand med goda förkunskaper inom bioinformatik och programmering. Den huvudsakliga arbetsuppgiften kommer att vara att bedriva forskarstudier inom ämnesområdet bröstcancer. Projektet omfattar bioinformatiska analyser med existerande och egenutvecklad mjukvara av data från storskalig sekvensering inklusive analyser av genetisk variation, mutationer och alternativ splicing. Statistiska analyser kommer också att utgöra en stor del av arbetet. Vidare så ingår vetenskapligt skrivande och läsning av aktuell vetenskaplig litteratur. Doktoranden förväntas också delta och presentera sin forskning på gruppmöten, seminarier och internationella vetenskapliga konferenser. Undervisning kan också komma att ingå i arbetsuppgifterna.

Kvalifikationer

Behörighet
Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Krav för anställning:

• Grundexamen i bioinformatik eller motsvarande.
• Goda kunskaper och praktisk erfarenhet inom programmering i Python, R och bash.
• Mycket goda kunskaper i engelska - både muntligt och skriftligt.

Meriterande för anställning är:

• Grundexamen eller kurser på universitetsnivå i matematik och/eller statistik.
• Erfarenhet av att arbeta med datorkluster och patientdata (känsliga data).
• Erfarenhet av att analysera RNA- och DNA-sekvenseringsdata.
• Erfarenhet av att analysera genetisk variation och mutationer i sekvenseringsdata, särskilt i cancer.
• Erfarenhet av att analysera alternativ splicing av mRNA.

Bedömningsgrund
Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor
Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.

Institutionen för kliniska vetenskaper i Lund (IKVL) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Institutionen har ett brett samarbete, såväl inom fakulteten som inom andra enheter vid universitet. IKVL har även ett väl utvecklat samarbete med Skånes universitetssjukhus (SUS) och Region Skåne samt det omgivande samhället och näringslivet. Detta för att främja klinisk och experimentell translationell forskning, utveckling och utbildning.