Bioinformatiker vid LUDC - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av arbetsplatsen

Lund University Diabetes Centre (LUDC; www.ludc.med.lu.se) utlyser härmed en tjänst som bioinformatiker. LUDC är ett av de största diabetesforskningscentren i världen med cirka 300 forskare och anställda som arbetar för förbättrad diagnostisering, prevention och behandling av diabetes. Centret kombinerar expertis inom genetik, epidemiologi, statistik, bioinformatik, molekylär- och cellbiologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi för att uppnå dessa mål.

Ett centralt tema för LUDC är att utveckla precisionsmedicin för att förbättra hälsan och livskvaliteten för diabetespatienter. Tjänsten som bioinformatiker är förlagd inom forskargruppen Diabetes och kardiovaskulär sjukdom som leds av professor Marju Orho-Melander och är placerad vid Clinical Research Centre (CRC) i Malmö. 

Sökanden inbjuds att ansöka om en tillsvidareanställning på heltid (100 %) som bioinformatiker vid LUDC. Anställningen inleds med sex månaders provanställning. Preliminärt startdatum är 2023-09-01 eller enligt överenskommelse.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal och möjlighet till distansarbete som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet, Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Vi söker en kvalificerad kandidat som kommer vara central för den fortsatta utbyggnaden av avancerad bioinformatik inom bl.a. tarmflora, genetik, kost, läkemedel och metaboliter och dess betydelse för kardiometabola sjukdomar inom ramen för professor Marju Orho-Melanders forskargrupp Diabetes och kardiovaskulär sjukdom.

Projektet kommer främst att fokusera på att undersöka sambanden mellan tarmflora, genetik, kost, läkemedel och metaboliter och risken för framtida diabetes och hjärtkärlsjukdomar i befolkningsbaserade studier.

Vi förväntar oss att sökanden är en erfaren bioinformatiker som kan analysera stora komplicerade dataset med hjälp av komplexa statistiska och bioinformatik metoder, som kan sammanfatta och presentera resultaten i en rapport inklusive publikationsfärdiga tabeller och figurer, samt bidra till artikelskrivande.

Behörighet och kvalifikationer

• Doktorsexamen i bioinformatik, biostatistik, biofysik eller närliggande område, med en dokumenterad meritlista i att tillämpa kvantitativa metoder för dataanalyser såväl som gedigen erfarenhet av programmering.
• En bevisad meritlista i att tillämpa kvantitativa metoder för dataanalysuppgifter och programmering samt högpresterande beräkningar.
• Kunskap om nästa generations sekvenseringspipelines och erfarenhet av att analysera och stora biologiska datamängder.
• Kunskaper i R och biostatisk analys.
• Kunskap och erfarenhet av andra programmeringsspråk (t.ex. Python).
• Gedigna kunskaper om GNU/Linux och ”bash scripting”.
• Erfarenhet av dataanalys och data mining för att identifiera trender och producera meningsfulla datavisualiseringar.
• Erfarenhet av att använda vanliga bioinformatiska verktyg och statistiska metoder (t.ex. DESeq, edgeR, GATK, PLINK, STAR, BWA, Salmon, Kallisto).
• Erfarenhet av webbaserade bioinformatikverktyg och offentliga biologiska databaser. Mjukvarudesign och implementering med Java.
• Kan samarbeta i ett tvärvetenskapligt team.
• Självgående, flexibel och kan arbeta självständigt på ett väldokumenterat sätt, att hantera flera projekt parallellt samt att prioritera och hålla deadlines.
• Dokumenterad muntlig och skriftlig språkfärdighet i engelska.

Vidare anses följande vara meriterande:

• Erfarenhet av att analysera stora mikrobiomdataset på art- (t.ex. meta-genomiska artantal och förekomster) och gennivå (t.ex. uttryck av funktioner i termer av KEGG-ortologer), samt erfarenhet av att genomföra utforskande, hypotestestande och hypotesgenererande analyser.
• God kunskap om enzymkatalys och proteinverkningsmekanismer.
• Erfarenhet av metabolomik, pathway-analys och kardiometabolisk sjukdom. Flera års forskningserfarenhet.
• Vi lägger också vikt vid personliga egenskaper och ser gärna individer som är motiverade, tar initiativ, är flexibla, detaljorienterade och kan arbeta självständigt på ett väldokumenterat sätt.

Övrigt

Anställningen är tillsvidare på heltid med önskat tillsträdesdatum 1 september, eller enligt överenskommelse. Anställningen kommer inledas med 6 månaders provanställning.

Så här söker du
Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska/bör även innehålla CV, publikationslista och uppgifter till 3 referenser.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.