Projektassistent i fysikalisk kemi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Arbetsuppgifter
Målet med projektet är att utföra coarse grain-simuleringar av protein som binder över cellkontakter. Detta ligger till grund för hur vårt immunförsvar aktiveras när det möter främmande smittoämnen och hur det kan skilja mellan våra egna celler och t. ex. bakterier och virus. Simuleringarna kommer specifikt användas för att bättre förstå observationer som nyligen gjorts av oss och kollegor när det gäller bindning i kontakten mellan en T-cell och ett modellsystem för en cellyta som kallas SLB (se t.ex. Junghans et al. doi: 10.1242/jcs.245985). 

Initialt i projektet kommer en simuleringsmodell utvecklas för coarse grain-simuleringar av protein som binder i kontakten mellan ett SLB och en cell. Detta kommer sedan användas till att studera:

• Bindning vid olika proteintäthet i SLBet och hur detta beror på om det finns ytterligare molekyler i kontakten som kan binda.
• Hur blandningar av olika protein (med olika längd, täthet, och bindningsaffinitet) påverkar bindningen.
• Bindning mellan de två proteinerna CD4 och T-cellreceptorer till samma cellreceptor (MHC).

Hur dynamiska, fingerlika strukturer på cellen som kallas mikrovilli påverkar protein-proteinbindning.

Krav

• Den sökande ska ha en MSc eller liknande utbildning inom ett område relevant för anställningen.
• Dokumenterad erfarenhet av datorsimuleringar av makromolekylära interaktioner. 

Övriga meriter:

• Erfarenhet av datorsimuleringar av proteinbindning över en cellkontakt.
• Erfarenhet av coarse grain-simuleringar av protein-proteininteraktioner.
• Erfarenhet av molekylsimuleringar (MC/MD) av biologiska membran.
• Kunskap i C/C++ programmering.
• Erfarenhet av avancerad dataanalys (Jupyter notebooks eller liknande).
• Kunnig och intresserad av biologi och immunförsvaret.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet. Hänsyn kommer att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka det administrativa arbetet inom avdelningen/institutionen (samt bidra till dess framtida utveckling).

Villkor
2-årig anställning
Önskat startdatum: snarast
Anställningens omfattning: heltid
Kontaktperson som ska stå i annonsen: Peter Jönsson (peter.jonsson@fkem1.lu.se)

Instruktioner för ansökan
Ansökan bör innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan bör även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).