Postdoktor i Biofysikalisk kemi

Särskild ämnesbeskrivning

Centrum för molekylär proteinvetenskap (CMPS), Kemiska institutionen, samlar forskare verksamma inom biokemi, molekylär biofysik, strukturbiologi samt fysikalisk och teoretisk kemi. Forskningen omfattar experimentella och teoretiska studier av biologiskt material. Vi behandlar molekylära frågor i biologiska system och studerar biologiska och designade proteiner med hjälp av en kombination av klassiska och avancerade tekniker inklusive optisk och NMR-spektroskopi, ytplasmonresonans, ljus- och röntgenspridning, kryoelektron- och fluorescensmikroskopi och röntgenkristallografi. De experimentella och teoretiska metoder som används har ofta sitt ursprung i fysiken. Betydande arbete ägnas åt proteiners självorganisering och samaggregering och interaktioner med andra biomolekyler.  Du kommer att ingå i Sara Linses forskargrupp vid CMPS. Forskargruppen bedriver främst forskning om peptider och proteiner som är kopplade till sjukdommar orsakade av att peptiden eller proteinet aggregerar och formar fibriller. Karaktärisering av systemen utförs både i rena och komplexa prover. Arbetet är fokuserat på utvecklingen av en universell cryo-Cage för strukturell analys av annars svåråtkomliga proteiner baserat på EF-hand-komplementering.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Projektet har två delar: i) utveckling av en universell cryo-Cage för strukturbestämning av proteiniers om annars är för små för cryo-EM, samt ii) tau aggregering ch diagnostik. Del i) fokuserar initialt på utveckling av cryo-Cages på molekylär nivå, inklusive proteindesign, uttryck, rening och validering av bildade Cages med hjälp av mikrofluidisk diffusionsbestämning, DLS, massfotometri och kryo-TEM-avbildning. När en funktionell design är nådd kommer arbetet att fokuseras på strukturbestämning med hjälp av kryo-EM av ett testprotein med känd struktur, följt av ett protein med delvis känd struktur och slutligen några proteiner med helt okänd struktur. Del ii) fokuserar initialt på taus aggreggering, inverkan av olika inhibitorer på dess aggregeringsmekanism, samt utveckling av tau-baserad diagnostik. Arbetet kommer också att inkludera författande  av manuskript samt handledning av kandidat- och masterprojekt.

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

• Dokumenterad erfarenhet av och kunskap om spektroskopiska och isotopbaserade experiment för att karaktärisera och följa proteiners självassociation till diskreta aggregat samt uppkomst av reaktionsintermediat samt uppkomst av reaktionsintermediat och utbyte av subenheter.
• Dokumenterad erfarenhet av och kunskap om proteinuttryck och utveckling av tag-fria reningsmetoder för att nå ultra-hög homogenitet.
• Dokumenterad erfarenhet av och kunskap om cryo-EM för strukturanalyser av proteiner och komplex mellan olika proteiner, inlusive proveredning och mikrokopi.
• Dokumenterad förmåga att söka och erhålla externa anslag till forskning

Övriga krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Dokumenterad fysikalisk-kemisk förståelse av proteiner i lösning och deras interaktioner med andra proteiner.

Bedömningsgrunder

Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Praktisk erfarenhet av och kunskap om cryo-EM för strukturanalyser av proteiner och komplex mellan olika proteiner, inlusive proveredning och mikrokopi.
• Praktisk erfarenhet av studier av proteiners löslighet och teoretisk kunskap om fenomenet.
• Praktisk erfarenhet av och kunskap om proteinuttryck och utveckling av tag-fria reningsmetoder för att nå ultra-hög homogenitet.
• Praktisk erfarenhet av och kunskap om spektroskopiska och isotopbaserade experiment för att karaktärisera och följa proteiners självassociation till diskreta aggregat samt uppkomst av reaktionsintermediat samt uppkomst av reaktionsintermediat och utbyte av subenheter.
• Erfarenhet av och förmåga att designa och utföra experiment för att utvärdera proteiners självorganisering.
• Förmåga att härleda ekvationer och skriva och använda kod för att analysera data om proteiners självorganisering och effekt av inhibitoer. Praktisk erfarenhet av isotop- och fluoroformärkning av proteiner.
• Praktisk erfarenhet av mätning av proteiners storleksfördelning, samt effekt av inhibitorer på självassociation
• Förmåga att söka och erhålla externa anslag till forskning
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max 2 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.