Denna annons är inte tillgänglig!
Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.
Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.
Lunds Universitet Diabetes Centrum (LUDC; www.ludc.med.lu.se) utlyser härmed en tjänst som bioinformatiker. LUDC är ett av världens största diabetes centra med cirka 300 anställda (forskare och övrig personal) som arbetar för att förebygga diabetes samt förbättra diagnostik och behandling av diabetes. För att nå dessa mål arbetar vi vid centret för att kombinera expertis inom genetik, epidemiologi, bioinformatik, molekylär och cell biologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi.
LUDC har en stor samling biobanker och databaser med helgenomsdata länkat till nationella register med information rörande sjukdomsuppkomst och sjukdomsförlopp, såväl som länkat till register rörande behandling och respons på behandling. Centret har egna plattformar för de flesta molekylära genetiska metoder och metabolomik. Omics-information kombinerat med utförlig fenotypdata möjliggör att vi kan använda oss av ”systems medicine” för att förstå komplexiteten av diabetes. En viktig del för LUDC är att utveckla individanpassad behandling för att förbättra hälsan och livskvaliteten för patienter med diabetes.
Arbetsuppgifter
Sökanden kommer att ingå i den centrala bioinformatik- och beräkningsinfrastrukturenheten för LUDC, som för närvarande består av 7 personer (inklusive bioinformatiker, en genetisk statistiker, en datahanterare, en datortekniker och en IT-datahanterare) som tillhandahåller bioinformatikrelaterat stöd till alla forskare inom LUDC-miljön.
Sökanden kommer att:
Utveckla, implementera och testa standardiserade pipelines för att stödja gemensamma NGS-analyser, inklusive, men inte begränsat till, RNA-seq, ChIP-seq, Exome-seq, etc.
Implementera anpassade bioinformatik och maskininlärningsalgoritmer för genomiska analyser
Kvalifikationer
Civilingenjör (MSc) i bioinformatik, matematisk statistik, datavetenskap
Erfarenhet i dataanalys och data mining för att identifiera trender och producera meningsfulla datavisualiseringar
Arbetskunskap om minst ett scripting språk (R eller Python, Pandas och numpy stack)
Erfarenhet av att arbeta i en Linux-miljö
Erfarenhet med versionsstyrningssystem som git eller mercurial
Följande är också meriterande:
Kunskap om ett programmeringspråk (Java, Scala, C ++)
Kunskap om public biologiska databaser och bioinformatiska verktyg
Kunskap om algoritmer för machine learning, som scikit-learning, Keras, Tensorflow
En bra förståelse för linjär algebra och multivariabel kalkyl
Erfarenhet av att arbeta i high performance computing environment
GitHub-profil med kodexempel är fördelaktig
Eventuella erfarenheter av att arbeta i en internationell miljö ses också som en tillgång
Vi kommer att främja individer som är flexibla, sociala, kan samarbeta, ta initiativ, vara detaljorienterade och arbeta på ett väl dokumenterat sätt.
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.
Anställningsform | Särskild visstidsanställning |
---|---|
Anställningen avslutas | 2019-08-31 |
Anställningens omfattning | Heltid |
Tillträde | 2013-03-01 |
Löneform | Månadslön |
Antal lediga befattningar | 1 |
Sysselsättningsgrad | 100 |
Ort | Malmö |
Län | Skåne län |
Land | Sverige |
Referensnummer | PA2019/272 |
Kontakt |
|
Facklig företrädare |
|
Publicerat | 2019-01-24 |
Sista ansökningsdag | 2019-03-13 |