Doktorand i biologi med inriktning molekylärbiologi

Ämnesbeskrivning

Biologi är det stora ämnet om allt levande. Det spänner över allt från processer på molekylär och cellulär nivå till globala processer på ekosystemnivå. Detta omfattande ämne indelas i ett antal mindre discipliner och ämnesinriktningar. Forskarutbildningen vid biologiska institutionen omfattar många av dessa inriktningar, från molekylärbiologi till tillämpad ekologi, från virus och enskilda celler till evolutionsbiologi och global biodiversitet. Att forskarutbilda sig vid biologiska institutionen innebär i regel en specialisering inom någon mer avgränsad del av hela biologins forskningsfält och kan omfatta fältarbeten, experiment, teoretiskt arbete, eller en kombination av dessa.

Mekanisk stimulering är en viktig faktor i hur växter är medvetna om kommande skadedjurs-/växtätarattacker, och hjälper dem att planera sin tillväxt och utveckling genom att fästa sig vid eller undvika hinder, justera tillväxthastigheter och reproduktion, anpassa sig till mycket väderexponerade miljöer, etc. Även om beröringsresponser hos växter har viktiga fysiologiska roller, är de underliggande molekylära signalvägarna dåligt förstådda. Mycket lite är känt om vilka sensorproteiner som kan detektera de mekaniska stimuli, eller hur denna initiala signal överförs från t.e. plasmamembranet till cellkärnan. Forskning i Olivier Van Akens laboratorium har identifierat regulatorer som är avgörande för denna snabba signalering, men mycket är kvar att utforska. Mekanisk stimulering av växter påverkar biomassa, blomning, men även stressmotståndskraft och avkastning. Att förädla nya grödor med förändrad beröringskänslighet, och att implementera kontrollerade mekaniska behandlingar på fältet eller i kommersiella växthus, ger därför lovande möjligheter till högre avkastning och miljövänligt jordbruk.

Detta projekt syftar till att reda ut viktiga processer som styr beröringskänslighet hos växter och utforska hur denna kunskap kan tillämpas för att förbättra grödans avkastning och hållbart jordbruk genom att fokusera på två kärnaspekter:

1) Vilken signalkaskad känner av och överför mekanisk stimulering inom sekunder och resulterar i genomomfattande genuttrycksförändringar inom 5–25 minuter?

2) Vilken inverkan har beröringssignalering i spannmålsgrödor på avkastning och stressresistens? Kan vi använda kontrollerad mekanisk behandling för att förhindra liggsäd som leder till avkastningsförlust?

Arbetsuppgifter

Forskaren kommer att arbeta vid Van Aken-laboratoriet med fokus på molekylär signalering i växter, som en del av avdelningen för molekylär biovetenskap vid biologiska institutionen. Den framgångsrika kandidaten kommer att ha tillgång till toppmoderna molekylära, biokemiska och genomiska anläggningar för att bedriva forskningen. Kandidaten kommer också att ha möjligheter att samarbeta med internationella grupper och handleda master- och/eller kandidatstudenter.

Huvuduppgiften för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna ingår det även medverkan i undervisning och annat institutionsarbete, dock max 20 % av arbetstiden.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har

• avlagt examen på avancerad nivå eller
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, med innehåll som är relevant för forskarutbildningen eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Kraven på särskild behörighet för biologi uppfyller den som har avklarat ett självständigt arbete (till exempel examensarbete) i relevant ämne omfattande minst 30 högskolepoäng, samt har goda kunskaper i det engelska språket, såväl skriftligt som muntligt.

Övriga krav:

• Avancerad utbildning i molekylärbiologi, biokemi eller relaterade områden, med laboratorieerfarenhet inom molekylärbiologi, genetik och/eller växtfysiologi, totalt motsvarande en Mastersexamen om 240 högskolepäng. Masterexamen ska vara avlagd innan antagning.
• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Mycket motiverad med stark förmåga att arbeta självständigt såväl som att samarbeta inom en forskargrupp.

Bedömningsgrunder

Urval till utbildning på forskarnivå sker efter bedömd förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Bedömningen av förmågan sker främst utifrån studieresultaten på grundnivå och avancerad nivå. Följande beaktas:

1. Kunskaper och färdigheter relevanta för avhandlingsarbetet och utbildningsämnet.
2. Bedömd förmåga till självständigt arbete och förmåga att formulera och angripa vetenskapliga problem.
3. Förmåga till skriftlig och muntlig kommunikation.
4. Övriga erfarenheter relevanta för utbildningen på forskarnivå, till exempel yrkeserfarenhet.

Övriga meriter:

Utöver de obligatoriska kraven kommer dokumenterad erfarenhet inom följande områden att betraktas som starka meriter:

• Praktisk erfarenhet av att arbeta med Arabidopsis thaliana, spannmål eller andra modellväxtarter är meriterande.
• Praktisk erfarenhet av molekylära och biokemiska tekniker såsom sekvensering, genotypning, bioinformatik, PCR, RNA-arbete, transkriptomanalys, proteinextraktion, western blot, (konfokal)mikroskopi
• Erfarenhet av fältarbete.
• Körkort för att åka till fältstationer för fältstudier.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv, självmotivation och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms ha den förmåga som behövs för att klara forskarutbildningen.

Villkor

Endast den som är antagen till forskarutbildning får anställas som doktorand. Forskarutbildningen är fyra år vid heltidsstudier. Vid undervisning och annat institutionsarbete förlängs anställningen i motsvarande grad, dock längst till 5 år (det vill säga max 20 %). Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1–7 §§.

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt forskningsprojektet matchar dina intressen och din utbildningsbakgrund. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etcetera).