Postdoktoral forskare inom interaktioner mellan fager och bakterier

Beskrivning av arbetsplatsen

Professor Vasili Hauryliuk är forskargruppsledare för gruppen för Molekylär Enzymologi vid Institutionen för Experimentell Medicinsk Vetenskap vid Lunds universitet. Hans forskargrupp arbetar med att struktur- och funktionskarakterisera de molekylära mekanismerna bakom bakteriellt antifageförsvarssystem.

Professor Vasili Hauryliuk leder gruppen för Molekylär Enzymologi vid Institutionen för Experimentell Medicinsk Vetenskap vid Lunds universitet. Hauryliuk-laboratoriet använder en kombination av mikrobiologiska, biokemiska och strukturella metoder för att studera mekanismerna bakom hur bakterier försvarar sig mot sina virus, bakteriofager. Professor Hauryliuk disputerade 2008 vid Uppsala universitet. Hans vetenskapliga insatser har uppmärksammats genom Ragnar Söderbergs medicinska forskningsstipendium (2014), det svenska Fernströmpriset (2019) samt Göran Gustafssonpriset (2024).

Laboratoriet är baserat vid Medicinska fakulteten vid Lunds universitet, vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap (EMV), för mer information se Vasili Hauryliuk - Lund University.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Vid Lunds universitet ska en anställning som postdoktor ge möjlighet till vetenskaplig och pedagogisk meritering. I första hand ges utrymme för meritering inom forskning, men även till viss högskolepedagogisk utbildning. Undervisning kan även ingå i arbetsuppgifterna.

Projektbeskrivning

Bakterier angrips ständigt av virus, bakteriofager. För att motstå dessa angrepp använder bakterier många olika antifageförsvarssystem, där det mest kända är CRISPR-Cas. I vårt laboratorium upptäcker vi nya system med hjälp av bioinformatik, validerar dem i mikrobiologiska tester och karaktäriserar sedan försvarsmekanismerna på molekylär nivå. För närvarande arbetar laboratoriet med många (>10) nya, ännu ej publicerade antifageförsvarssystem. Fokus för detta projekt skulle vara att avslöja deras molekylära funktioner genom en integrerad struktur-funktionell ansats som kombinerar fagemikrobiologi, biokemi och strukturell biologi. Projektet övervakas av Vasili Hauryliuk (PI) samt Gemma Atkinson (co-PI, strukturell bioinformatik, Lunds universitet) och Pontus Gourdon (co-PI, kryo-EM, Lunds universitet och Köpenhamns universitet).

Referenser:

Mets et al. Cell Host Microbe 2024

Ernits et al. 2023

Zhang et al. Nature 2022

Kurata et al. Mol. Cell 2021

Beskrivning av AMBER-projektets sammanhang

Denna postdoktorala tjänst är en del av EU:s samfinansierade forskningsprojekt AMBER, Advanced Multiscale Biological imaging using European Research infrastructures, som kommer att ta itu med vetenskapliga och sektoriella luckor i biologisk avbildning från molekylär, via cellulär, till vävnads-, organ- och organismnivå, och samordnas av LINXS Institute of advanced Neutron and X-ray Science.

AMBER finansieras av EU:s Marie Skłodowska-Curie (MSCA) COFUND-program.

Cirka 20 postdoktorer kommer att rekryteras i den fjärde utlysningen 2025, varje tjänst är 36 månader.

AMBER har sex samverkanpartners: Lunds universitet/MAX IV, Sverige, European Spallation Source (ESS), Sverige, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Institut Laue-Langevin (ILL), Frankrike, International Institute of Molecular Mechanisms and Machines, (IMOL), Polen, och Leicester Institute of Structural and Chemical Biology, Storbritannien.

Ditt arbete kan omfatta kliniska och biomedicinska projekt. Det kan också omfatta teknikutvecklingsarbete som syftar till att kombinera avbildningstekniker och dataanalys för att ge en mer integrerad bild av livsprocesser i samband med hälsa och sjukdom. Som postdoktor inom AMBER-programmet får du tillgång till oöverträffade medicinska, biologiska och metodologiska möjligheter, med en djupgående potentiell inverkan på Europas nästa generation av forskning och forskare. När du har slutfört AMBER-programmet kommer du att vara utomordentligt välutrustad för att främja din karriär inom den akademiska världen, vid infrastrukturer, inom hälso- och MedTech-sektorerna och därefter.

För mer information om de totalt utlysta postdoktorala tjänsterna inom AMBER co-fund-projektet, besök https://www.euraxess.se/jobs/341970.

Intervjuerna kommer att inledas i november 2025. För mer information om AMBER, ansöknings- och utvärderingsprocessen etc., besök: ambercofund.eu.

Kvalifikationer

Minimikrav för anställningen: 

• Kandidaten måste ha högst 8 år efter en doktorsexamen (PhD), enligt vad som krävs i projektets Grant Agreement som undertecknats med Europeiska kommissionen,
• Minst en originalpublikation i en fackgranskad tidskrift,
• En bakgrund inom relevanta metoder,
• Ett komplett ansökningspaket som lämnas in via AMBER-portalen (inklusive CV och detaljerad forskningsplan), och slutligen
• Strikt efterlevnad av MSCA:s mobilitetsregel om att forskaren inte får ha varit bosatt eller bedrivit sin huvudsakliga verksamhet (arbete, studier etc.) i värdorganisationens land under mer än tolv månader under de tre åren omedelbart före utlysningens sista ansökningsdag.

Varje projekt kommer att ha ytterligare specifika krav som kandidaterna måste uppfylla, se till att kontrollera vilka dessa är innan du ansöker.

Krav för anställningen är: 

• Doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen inom molekylärbiologi, biokemi, strukturbiologi eller ett relaterat ämne. Doktorsexamen ska vara avlagd senast vid tidpunkten då anställningsbeslut fattas,
• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet,
• Pedagogisk förmåga,
• En publikationshistorik i internationella tidskrifter,
• Behärskning av talad och skriven engelska,
• Erfarenhet av standardmetoder inom molekylärbiologi, såsom molekylär kloning,
• Kompetens inom åtminstone en av de nyckelapproacher som ska användas i detta tvärvetenskapliga projekt: fagmikrobiologi och/eller strukturbiologi, specifikt kryo-EM.

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du är både strukturerad i ditt arbete och självgående.

Bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss.

Om anställningen

Anställningen är en visstidsanställning på tre år, 100% med startdatum den 2026-01-01 eller enligt överenskommelse. Anställningar vid Lunds universitet bedrivs i Sverige, du förväntas därför kunna utföra ditt arbete på plats i Lund.

Anställningen är tidsbegränsad till max tre år enligt kollektivavtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor (Arbetsgivarverket). En anställning som postdoktor är tänkt som ett inledande steg i karriären och som en möjlighet att ytterligare fördjupa och bredda forskningskompetens.

Instruktioner för hur du ansöker

För mer information och dokument/mallar/europass-länk, besök https://www.ambercofund.eu/for-applicants.

Ofullständiga ansökningar kommer inte att beaktas. Se till att du laddar upp alla nödvändiga dokument som anges nedan i-ix.

Om du är intresserad av att söka mer än en tjänst (högst 3) måste du vara beredd att lämna in en fullständig ansökan för varje enskild tjänst.

Ansökningarna ska skrivas på engelska och alla dokument ska vara i pdf-format.

i) En meritförteckning (europass-format). Ditt CV ska exporteras till en PDF-fil som du använder i din ansökan.

ii) En detaljerad forskningsplan inklusive eventuella planerade utstationeringar (kandidater kan föreslå fler än den obligatoriska, de kan också föreslå sina egna utstationeringar), skolor och konferenser samt en mall för budgetplan. (så kortfattad som möjligt, Forskningsplanen ska vara så kortfattad som möjligt, 3 sidor, inklusive en tredjedels sida för sammanfattning/abstract.

Ytterligare texter som ska inkluderas i PDF:en är:

iii) Letter of Commitment från eventuella ytterligare secondment partners

iv) Bevis på kunskaper i engelska (minst CEFR B22, kontrolleras även vid intervjun).

v) Ett utkast till en individuell karriärutvecklingsplan (ICDP).

vi) Två referensbrev.

vii) Eventuella ytterligare dokument som stöd för ansökan.

viii) Etiskt frågeformulär (checklista för högskoleetik + forskningsetiskt åtagande)

Dessutom kommer ansökan att kräva:

ix) Varje kandidat kan ansöka om högst 3 tjänster. Du måste ansöka för varje enskild tjänst. En lista med önskad ordning på tjänsterna ska skickas till AMBER-ledningen. amber@linxs.se

Mer om Medicinska fakulteten