Forskare i hybridiseringsinducerade ändringar i genuttryck

Ämnesbeskrivning

Vi rekryterar en forskare tidigt i karriären för en ettårig karriärsutvecklingsposition inom ERC-projektet "Hybridization derived novel patterns of gene expression”.
Projektet undersöker genuttryckets roll i hur ny variation och evolutionära anpassningar kan uppstå genom hybridisering. De specifika forskningsfrågorna som ska besvaras kommer att utvecklas i diskussioner med den utvalda kandidaten och teamet, men den huvudsakliga frågeställningen inom projektet är i vilken utsträckning ändringar i metylering och kromatin uppstår som följd av hybridisering, och hur/i vilken grad dessa ändringar bidrar till förändrat genuttryck i hybrider.
Projektet bygger på vårt unika data set bestående av tre oberoende linjer av hybridarten Italiensk sparv samt deras föräldraarter. Vi har provtagit och håller nu på att extrahera genuttrycksdata från olika vävnader för ca 10 individer av varje kön från dessa populationer.
Forskaren kommer att samarbeta nära med kollegor som genomför genuttrycksanalyser, och själv leda analys av metylerings- och ATAC-seq data, samt syntetisera arbetet för publikation.
Forskaren kommer att arbeta nära HybridExpress-teamet bestående av en labmanager, en doktorand och en post doc. Det kommer att finnas möjligheter till mentorskap. Projektet leds av universitetslektor Anna Runemark vars lab är en del av SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen inom divisionen biologisk mångfald och evolution.

Arbetsuppgifter

De huvudsakliga uppgifterna i en forskartjänst är att bedriva forskning.

Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna:

• Bioinformatisk analys av genuttrycksdata
• Analys av metylering och histonmodifieringar, med fokus på deras effekter på genuttryck
• Tolkning av bioinformatiska resultat, figurberedning
• Syntetisera data för publicering

Kandidaten kan potentiellt bidra till undervisningen på bioinformatikprogrammet.

Krav 

För anställning till denna karriärutvecklingstjänst krävs att den sökande har en doktorsexamen, eller en internationell examen som bedöms likvärdig med en doktorsexamen, inom genetik, genomik, evolutionär biologi med bioinformatiska metoder eller molekylär biologi med evolutionära frågeställningar. Även om det inte finns några formella krav på karriärålder, syftar tjänsten till karriärutveckling för en forskarkarriär och meriter kommer att beaktas i ljuset av karriäråldern.

Meriterande

Detta är en position menad för karriärsutveckling för en framtida akademisk karriär med forskningsfokus. Positionen är tänkt som ett första steg i en karriär och utvärdering av sökande kommer primärt baseras på deras forskningskvalifikationer och potential som forskare. Särskild tyngd kommer läggas på färdigheter inom forskningsämnet i.e., hybridiseringsgenomik och/eller reglering av genuttryck.

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet, vilket bedöms av publikationshistorik med starka självständiga bidrag och publikationer av hög kvalitet.
• Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av metylering och histonmodifiering, genuttrycksdata och/eller analys av hybridgenom.

Vidare bedömningskriterier

• Kunskap om utveckling av repeterbara arbetsflöden såsom snake-make.
• Körkort giltigt i Sverige.

Övriga egenskaper som kommer tas i beaktande är goda samarbetsegenskaper, handlingskraftighet och självständighet, samt hur sökandens erfarenhet och färdigheter kompletterar den pågående forskningen inom institutionen och dess utveckling.

Villkor mm
Tidsbegränsad, heltidsanställning under 1 år, preliminärt startdatum 2025-10-01 eller enligt överenskommelse. 

Kontaktperson: Anna Runemark anna.runemark@biol.lu.se

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska skrivas på engelska, kompileras till en enda pdf och innehålla:

• Meritförteckning/CV (max 2 sidor)
• Publikationslista
• Ett cover letter som beskriver hur din tidigare forskning matchar positionens krav samt om framtida forskningsintressen (max 2 sidor)
• Kontaktuppgifter till minst två akademiska referenser
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen