Postdoktor i utveckling av SERS för jordsvampars sekundära metaboliter - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Särskild ämnesbeskrivning

Jordsvampar spelar en avgörande roll i globala biogeokemiska cykler, främst genom nedbrytning av komplext organiskt material. Svampsamhällets övergripande funktion och produktivitet påverkas avsevärt av interspecifika interaktioner och konkurrens om resurser. Detta i sin tur påverkar de biogeokemiska kretsloppen och flödena av inandad CO2 från marken. Inför klimatförändringar och andra mänskliga aktivitetsinducerade förändringar av miljöförhållanden är en bättre förståelse för grundläggande mekanismer bakom dessa svampinteraktioner nödvändig för att bestämma riktningen för totala nedbrytningshastigheter och säkerställa att våra jordar fungerar som övergripande sänkor och inte utsläppare av kol.

För att överleva i en resursbegränsad miljö har svampar utvecklat medel för interspecifik kommunikation och krigföring via en arsenal av utsöndrade sekundära metaboliter. Den specifika ekologiska rollen för dessa metaboliter och i vilken utsträckning de påverkar det biogeokemiska kretsloppet under svampinteraktioner är fortfarande okänd. Eftersom de utsöndras och verkar i en encellig skala kan spårning av dem "där och då" hjälpa till att identifiera potentiella triggers för deras produktion och klargöra deras funktion. För närvarande använda metoder har antingen otillräcklig upplösning eller är destruktiva och inte lämpliga för sådana analyser.

Syftet med detta mycket tvärvetenskapliga European Research Council (ERC)-finansierade projekt är att upprätta experimentella protokoll för identifiering och karakterisering av jordsvamps sekundära metaboliter i encellig skala med hjälp av ytförstärkt Raman-spridning (SERS) mikrospektroskopi - en metod som använder optiska egenskaper av guld nanopartiklar för molekylspecifik avkänning och som har visat sig i biomedicinsk forskning ha en extraordinär potential för att studera mikrobiella metaboliska processer. För detta kommer SERS-substrat för guldnanopartiklar att produceras och införlivas i mikrofluidikbaserade jordchips, vilket möjliggör särskiljning av de interagerande svampcellerna och ger visuell tillgång till dem som växer i strukturer som efterliknar verkliga ekosystem via kontroll över biotiska och abiotiska miljöer. Dessutom kommer de viktigaste sekundära metaboliterna som ska detekteras att identifieras med hjälp av anpassad vätskekromatografi-masspektrometri (LC-MS) och kärnmagnetisk resonans (NMR)-tekniker i extraktioner erhållna från svampmonokulturer (ingen konkurrens) och samkulturer för att tjäna som referensinformation.

Denna postdoktortjänst är den första som tillsätts i ERC-projektet, där ytterligare en postdoktor och en doktorand planeras att anställas under de kommande två åren.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning, bestående av utveckling av protokoll för syntesen av guldnanopartiklar (främst kolloider) och inkorporering i mikrofluidiska jordchipsstrukturer för SERS-substratproduktion. Ytterligare uppgifter inkluderar karakterisering av de fysikaliska och optiska egenskaperna hos de producerade substraten, samt identifiering av de viktigaste sekundära svampmetaboliterna i de extraktioner som erhållits från svampkulturer med hjälp av LC-MS- och NMR-tekniker som finns tillgängliga vid öppna anläggningar vid Lunds universitet. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Arbetsuppgifterna innefattar även:

• Utveckla protokoll för syntes och karakterisering av guldnanopartiklar av olika former och storlekar, huvudsakligen med användning av flytande kolloidberedningsmetoder
• Inkorporera de preparerade nanopartiklarna i mikrofluidiska jordchipsstrukturer och utföra SERS-mikrospektroskopimätningar av jordsvampsmetaboliter.
• Förbereda metabolitextraktioner från laboratorieodlade svampkulturer och karakterisera dem med LC-MS- och NMR-metoder
• Analysera producerade spektraldata.
• Vetenskapligt skrivande.

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde. Särskild vikt kommer att läggas på vetenskaplig förmåga inom ämnesområdena analytisk kemi (särskilt Raman-mikrospektroskopi), nanovetenskap och nanoteknik, men även andra ämnesområden kan komma i fråga om de bedöms relevanta för projektet. Forskarutbildningen ska vara avslutad senast tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga krav:

• Erfarenhet av att arbeta med spektroskopimetoder, särskilt Raman (mikro)spektroskopi, gärna inklusive tillämpningar av SERS
• Erfarenhet av spektraldataanalys
• Mycket god muntlig och skriftlig förmåga i engelska.

Meriter:

• Erfarenhet av nanopartikelsyntes
• Erfarenhet av att förbereda prover för och utföra LC-MS och NMR-analyser.
• Erfarenhet av arbete med biologiska prover

Bedömningsgrunder
Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Uppfyllelse av ovanstående krav.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till 2 år och avser heltid med möjlighet till förlängning. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• Följebrev, inklusive en generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.