Forskare i biofysikalisk kemi

Beskrivning av arbetsplatsen
Centrum för molekylär proteinvetenskap (CMPS), institutionen för kemi (KILU) samlar forskare verksamma inom områdena biokemi, molekylär biofysik, strukturbiologi samt fysikalisk och teoretisk kemi. Vi studerar biologiska och designade proteinsystem med en kombination av klassiska och avancerade tekniker inklusive optisk och NMR-spektroskopi, ytplasmonresonansteknologi, ljus- och röntgenspridning, kryoelektron- och fluorescensmikroskopi samt röntgenkristallografi.

Du kommer att ingå i Sara Linses forskargrupp, Biokemi & Strukturbiologi i nära samarbete med Ulf Olsson, Fysikalisk kemi. Arbetet kommer att fokuseras på proteiners själv- och ko-aggregering till amyloidfibriller samt chaperon-amyloidprotein-ko-aggregat. Du kommer att använda en rad molekylärbiologiska och spektroskopiska metoder samt yttekniker.

Ämnesbeskrivning
Biofysikalisk kemi innebär forskning inriktad mot molekylära frågeställningar i biologiska system. De experimentella och teoretiska metoder som används har ofta sitt ursprung i fysiken. Den biofysikaliska kemiforskningen inom KILU  vid avdelningarna biokemi och strukturbiologi, biofysikalisk kemi samt fysikalisk kemi omfattar experimentell och teoretisk forskning om biologiska system. Betydande arbete ägnas åt själv- och samassociation av proteiner samt deras interaktioner med andra biomolekyler. Det aktuella projektet fokuserar på en klass av chaperoner som genom interaktioner ökar lösligheten av andra proteiner och därigenom förhindrar eller fördröjer utfällning och amyloidbildning. Arbetet kommer att fokuseras både på transienta och sluttillstånds-samaggregat av chaperoner och amyloidproteiner

Arbetsuppgifter
En forskares huvudsakliga uppgift är att bedriva forskning. Handledning av studenter på kandidat- och masternivå kan också ingå.

Arbetet kommer att fokuseras på proteiners självassociation och chaperon-protein sam-associering med syfte att förstå den termodynamiska grunden för hur en klass av chaperoner förbättrar lösligheten av andra proteiner, klienter. Studier av chaperoneeffekter på självassociationsprocesser kommer också att inkluderas i syfte att mäta chapeoners effekt på hastighetskonstanter för underliggande reaktionssteg.

Arbetsuppgifterna innefattar exempelvis:
Experimentella studier av chaperoners självassociation, chaperon-klient-interaktioner och samaggregering med amyloidbildande proteiner. Syftet är att karakterisera och förstå de grundläggande protein-proteininteraktionerna, och den molekylära förklaringen av löslighetsförbättring hos klienter med hjälp av fluorescens-, cirkulär dikroism- och NMR-spektroskopi, spridningstekniker, ytplasmonresonansteknologi och kalorimetri. Arbetet kommer att innefatta uttryck och rening av chaperoner och amyloidproteiner. Arbetet kommer att inkludera metodutveckling för en rad biofysiska experiment som syftar till bestämning av storleksfördelningar, fördelningskoefficienter, stökiometrier, jämvikt kontra kinetisk kontroll, energibarriärer och samaggregatstrukturer över en rad längdskalor.

Du kommer att ha specifikt ansvar för proteinuttryck, rening, metodutveckling för biofysiska experiment samt genomförande och analys av data från sådana experiment. Du kommer att ansvara för detaljerad dokumentation av alla experiment och skrivande av vetenskapliga artiklar.

Krav för anställningen

• Avlagd doktorsexamen eller motsvarande forskarexamen inom anställningens ämne (fysikalisk kemi, biofysikalisk kemi eller biokemi) med fokus på de molekylära faktorer som styr amyloidbildning.
• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Utmärkt kunskap och dokumenterad expertis inom experimentella biofysiska studier av proteiners självassociation, inklusive fluorescens- och cirkulär dikroismspektroskopi samt ytplasmonresonansteknologi.
• Utmärkt kunskap och dokumenterad expertis inom global kinetisk analys för bestämning aggregeringsmekanismer och hastighetskonstanter för underliggande steg i mekanismerna.
• Utmärkt kunskap och dokumenterad expertis inom proteinuttryck och rening av taggfria proteiner med hjälp av jonbyte, hydrofob interaktion och gelfiltreringskromatografi.
• Dokumenterad expertis inom utveckling av reningsmetoder med dessa verktyg.
• God analytisk förmåga och programmeringsförmåga i Python.
• Förmåga att arbeta självständigt och att formulera och angripa forskningsproblem.

Meriterande för anställningen
Bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras forskarkvalifikationer och potential som forskare, särskilt förmåga att utveckla och bedriva forskning av hög kvalitet. Särskild vikt kommer att läggas vid forskningsförmåga inom ämnet.

Företräde ges till sökande som varit involverad som projekthandledare eller mentor för studenter på kandidat- eller masternivå.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor mm
Tillsvidareanställning på heltid med önskat startdatum 2025-01-01. Provanställning kan komma att tillämpas.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla ett CV inklusive publikationslista samt ett personligt brev som motiverar ditt intresse för tjänsten och hur det matchar dina kvalifikationer. Ansökan bör också innehålla ett examensbevis eller motsvarande och alla andra dokument som du vill åberopa (kopior av betygsutdrag, uppgifter om referenter, rekommendationsbrev, etc.).