Lunds universitet, Lunds Tekniska Högskola, Kemiska institutionen

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 40 000 studenter och 7 400 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds Tekniska Högskola, LTH, är en teknisk fakultet inom Lunds universitet med forskning av hög internationell klass och stora satsningar på pedagogisk mångfald.

ScanOats är ett nyetablerat forskningscentrum i samverkan mellan akademi och industri och bedriver forskning om havre och havrebaserade produkter. Havre är en viktig gröda både för det svenska lantbruket och för livsmedelsindustrin. ScanOats är unikt genom att det täcker hela kedjan från grundforskning och växtförädling, över fältförsök, processning av näringskomponenterna, och kliniska hälsostudier.

Arbetsuppgifter
Vi söker en motiverad och erfaren bioinformatiker till ScanOats Industrial Research Centre för att utföra arbete inom havre-genomik. Vi har nyligen sekvenserat och assemblerat det hexaploida genomet och en djupanalys kan nu påbörjas. En entusiastisk inställning att vetenskapligt ta itu med detta 12,5 Gbp hexaploid genomet är nödvändigt. Din roll är att arbeta med karakterisering av havregenomet, inklusive olika mutanter, samt utveckla metoder för analys och integration av sekvensdata i enlighet med de mål som formulerats av ScanOats. Våra forskningsområden inkluderar: 1) lipider och lipaser, 2) totala fibrer, 3) antioxidanter, 4) proteiner och 5) Fusarium-resistens. Du kommer framförallt att samverka med forskare inom biokemi, växtförädling, bioteknik och bioinformatik, men även med forskare i de övriga projekten inom ScanOats samt med ScanOats företagspartners Lantmännen, Oatly och Swedish Oat Fiber.

Arbetsuppgifterna innefattar bland annat att:

  • Applicera moderna verktyg, färdigheter och metoder inom genom-forskning
  • Utveckla nya algoritmer och strategier för genom-analys.
  • Förstå de grundläggande vetenskapliga frågorna och välja analysmetoder baserade på denna kunskap.
  • Delta i automatiserad och manuell annotering av havre-genomet, synteny-analys, transkriptom-analys, identifiering av markörer för mutantegenskaper.
  • Samarbeta med akademiska/industriella forskare på nationell och internationell nivå.
  • Assistera i handledning av doktorander och master-studenter.
  • Arbeta med integration och tolkning av resultat från omics dataset.
  • Systemadministration.
  • Delta i utvecklingen av ”genome browsers”.
  • Ansöka om forskningsanslag vid behov
  • Tjänstgöring utomlands för att arbeta med internationella forskare under veckor till månader kan bli aktuellt.

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

  • En examen i växtgenetik, evolutionärbiologi, bioinformatik, beräkningsbiologi, statistik eller annat relaterat område.
  • En bred förståelse för de statistiska aspekterna av bioinformatik och den underliggande genetiken.
  • Erfarenhet av sekvensanalys av stora datamängder.
  • Programmeringsfärdigheter i Python och kunskap i R.
  • Erfarenhet av Linux och högpresterande datormiljöer, exempelvis molnbaserade tjänster.
  • Erfarenhet i genom-analys, variant calling, RNA-Seq, annotering, programmering, och databashantering.
  • Intresse av tvärvetenskaplig forskning samt förmåga att arbeta självständigt såväl som i grupp.
  • Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet - en positiv attityd är viktig för vår arbetsmiljö. Vi söker dig som har god förmåga att samverka med många olika parter och har god samarbetsförmåga. Du är flexibel, drivande och självständig. Hänsyn kommer också tas till hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens förväntas komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen.

Övriga meriter:

  • Erfarenhet av webb-programmering.
  • Erfarenhet inom växtförädling.
  • Erfarenhet av praktisk molekylärbiologi.
  • Erfarenhet av karakterisering av eukaryota genom, företrädesvis växter, företrädesvis polyploider.
  • Intresse för att utveckla pipelines.
  • Förmåga/intresse av att utveckla/tillämpa statistiska eller maskininlärnings-metoder.
  • Förteckning över publikationer.

Villkor
Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 2 år. Vårt anställningsbehov kan eventuellt bli längre än 2 år.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska skrivas på engelska. Redovisa dina meriter enligt LTHs akademiska meritportfölj, se länk nedan. Ladda upp som PDF-filer i rekryteringssystemet. Läs mer här: http://www.lth.se/omlth/ledigatjanster/soeka-laeraranstaellning-vid-lth/

Anställningsform Tijdelijk dienstverband langer dan 6 maanden
Anställningens omfattning Heltid
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2018/1887
Kontakt
  • Nick Sirijovski, forskare, 073 4272250, 046-222 72 53, nick.sirijovski@tbiokem.lth.se
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
  • SEKO: Seko Civil, 046-222 93 66
Publicerat 2018-06-08
Sista ansökningsdag 2018-07-08

Terug naar vacatures