Postdoktor i Beräkningskemi: Spridning i biomolekylära lösningar

Beskrivning av ämnet

Denna postdoktorala tjänst är en del av EU:s samfinansierade forskningsprojekt AMBER, Advanced Multiscale Biological imaging using European Research infrastructures, som kommer att fylla vetenskapliga och sektoriella luckor i biologisk avbildning från molekylär, via cellulär, till vävnad, organ och organism nivåer av organisation, och samordnas av LINXS, Lund Institute of advanced Neutron and X-ray Science.

AMBER finansieras av EU:s Marie Skłodowska-Curie (MSCA) COFUND-program. Cirka 14 postdoktorer kommer att rekryteras i den första utlysningen, och varje anställning varar i 36 månader.

AMBER har sex kärnpartner: Lunds universitet/MAX IV, Sverige, European Spallation Source (ESS), Sverige, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Institut Laue-Langevin (ILL), Frankrike, International Institute of Molecular Mechanisms and Machines, (IMOL), Polen, och Leicester Institute of Structural and Chemical Biology, Storbritannien.

Ditt arbete kommer att omfatta kliniska och biomedicinska projekt. Det kommer också att omfatta teknikutvecklingsarbete som syftar till att kombinera avbildningstekniker och dataanalys för att ge en mer integrerad bild av livsprocesser i samband med hälsa och sjukdom. Du får som post doktor inom AMBER-programmet stora medicinska, biologiska och metodologiska möjligheter, med en djupgående potentiell inverkan på Europas nästa generation av forskning och forskare. När du har avslutat AMBER-programmet kommer du att vara utomordentligt väl rustad för att fortsätta din karriär inom den akademiska världen, vid infrastrukturer, inom hälso- och MedTech-sektorerna och därefter.

För mer information om de totalt utlysta postdoktorala tjänsterna inom samfinansieringsprojektet AMBER, besök https://www.euraxess.se/jobs/178170

Intervjuerna kommer att inledas i april. För mer information om AMBER, ansöknings- och utvärderingsprocessen etc., besök: https://www.ambercofund.eu 

Särskild ämnesbeskrivning 

Forskningen av PI, prof. Mikael Lund, omfattar ett brett spektrum av områden inom disciplinen statistisk termodynamik, inklusive grundläggande teoretisk forskning (som ofta resulterar i nya teorier och simuleringstekniker), såväl som mer riktade studier, med tillämpningar inom Life Science, kolloidal vetenskap och biofysikalisk kemi. Avdelningen för beräkningskemi bedriver forskning inom kvantkemi, statistisk termodynamik, fysikalisk kemi och biofysikalisk kemi.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Detta forskningsprojekt fokuserar på att förstå protein-protein och protein-protein proxy interaktioner i komplexa lösningar med hjälp av avancerad molekyldynamik (MC) och Metropolis-Hastings Monte Carlo (MC) simuleringar, kombinerat med experimentella tekniker. Vi kommer att undersöka hur co-soluta som salt; små molekyler; och osmolyter i allmänhet påverkar biomolekylär stabilitet och konformation. Detta är viktigt för grundläggande förståelse av biologi, men också för att effektivt kontrollera biomolekylära interaktioner i till exempel vaccin- och läkemedelsutveckling. Experimentella tekniker såsom lågvinkelröntgenspridning; spridning av neutroner; osmometri; och UV/VIS/fluorescensspektroskopi kommer att kombineras med klassisk termodynamik och MD/MC-simulering för att få en djup förståelse av de fysikaliska mekanismer som spelar in. Denna uppgift innebär utveckling av nya grovkorniga represenationer och modeller av biomolekyler och co-soluta baserat på en ytarea-metod. Vi kommer att vidareutveckla beräkningseffektiva algoritmer för att efterlikna lösningsspridning från ensembler av mikrotillstånd samplade med MD/MC. Det senare kommer att implementeras inom ramen för vår egen programvara och valideras mot experimentella data.

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnes-område och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• En stark bakgrund inom fysikalisk kemi, bekant med både teoretiska och experimentella tekniker för att bedöma termodynamik och interaktioner i (bio)molekylära lösningar, till exempel osmometri, UV/VIS/fluorescensspektroskopi, molekyldynamik eller Monte Carlo-molekylära simuleringstekniker.
• Erfarenhet av Python samt av kompilerade, moderna programmeringsspråk som Rust eller C++.
• Kandidaten måste ha högst 8 år efter en doktorsexamen (PhD), enligt kommissionens krav, i enlighet med Horizon-Europe MSCA cofund project Grant Agreement
• Minst en originalpublikation i en referentgranskad tidskrift,
• Bakgrund inom relevanta metoder,
• Ett fullständigt ansökningspaket som lämnas in via AMBER-portalen (inklusive meritförteckning och detaljerad forskningsplan), och slutligen
• Strikt efterlevnad av MSCA:s rörlighetsregel om att forskaren inte får ha varit bosatt eller bedrivit sin huvudsakliga verksamhet (arbete, studier osv.) i värdorganisationens land mer än tolv månader under de tre år som omedelbart föregår sista ansökningsdag.

Bedömningsgrunder

Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

• Erfarenhet av Rust är meriterande.
• Erfarenhet från SAXS/SANS-experiment, inklusive tolkning av data.
• Kompetens inom spridningsområdet och spridningsteorier.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till 3 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbe-gränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Önskat startdatum är 2025-08-01 eller enligt överenskommelse.

Instruktioner för hur du ansöker

Mer information finns på www.ambercofund.eu.

Om du är intresserad av att söka mer än en tjänst (högst 3) måste du vara beredd att lämna in en fullständig ansökan för varje enskild tjänst.

Ansökan ska skrivas på engelska och sammanställas i en PDF-fil som innehåller:

i) En meritförteckning (europassformat). Detta skapas genom att du registrerar dig och använder Europass-portalen här: https://europa.eu/europass/en/create-europass-cv

Din meritförteckning kan sedan exporteras till en PDF-fil som du använder i din ansökan.

ii) En detaljerad forskningsplan som omfattar alla planerade utstationeringar (sökande kan föreslå fler än den obligatoriska, de kan också föreslå sina egna utstationeringar), skolor och konferenser samt en mall för budgetplan. (så kortfattad som möjligt, rekommenderat ca 3-5 sidor, men absolut maximalt 10 sidor. Forskningsplanen bör innehålla en halv sida med sammanfattning/abstract. Mallen kan laddas ner från sidan "For applicants", här: https://www.ambercofund.eu/for-applicants

Ytterligare texter att inkludera i PDF-filen är:

iii) Åtagandeförklaring från eventuella ytterligare partners som den sökande vill knyta till sig.

iv) Bevis på kunskaper i engelska (minst CEFR B22, kontrolleras även vid intervjun).

v) Ett utkast till individuell karriärutvecklingsplan (ICDP).

vi) Två referensbrev.

vii) Eventuella ytterligare dokument till stöd för ansökan.

viii) Etiskt frågeformulär (checklista för etik inom högre utbildning + forskningsetiskt åtagande) länk kommer att finnas på sidan "For applicants", här: https://www.ambercofund.eu/for-applicants

Dessutom kommer ansökan att kräva:

ix) Varje kandidat kan ansöka om högst 3 tjänster. Du måste ansöka för varje enskild tjänst. En lista med preferensordning för tjänsterna ska skickas till AMBER-ledningen. amber@linxs.se Mallen kan laddas ner från sidan "For applicants", här: https://www.ambercofund.eu/for-applicants

x) En förinspelad videopresentation (frågeformulärsstyrd, via online videoverktyg, cirka 10 minuter). När du har slutfört resten av ansökningsförfarandet kommer behöriga sökande att få en länk skickad till sig.