Doktorand Neurala Stamceller - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av verksamhet

Vid forskargruppen för Neurala stamceller bedrivs forskning om hur hjärna utvecklas. Forskningen har sedan flera år legat i framkant inom stamcellsfältet där vi använder reprogrammering, iPS celler, stamceller och neural differentiering för att skapa och studera modeller av den humana hjärnans utveckling. Vidare använder vi den kunskap vi tar fram om humana neurala stamceller för att utveckla nya cell-baserade behandlingar. Gruppen leds av professor Anna Falk och består av både forskande och teknisk personal. Verksamheten är lokaliserad på Biomedicinskt centrum i Lund. Här kan du läsa mer om vår spännande forskning.

Projektbeskrivning

Huvudsyftet med doktorandprojektet är att studera signaler som är viktiga för att etablera neuroepitelial stamceller (NES) på rätt sätt under tidig utveckling av den mänsklig hjärna. Vi kommer att tillämpa bioinformatik på olika omics-data för att först kartlägga de kritiska mekanismerna för optimal neural induktion till NES-celler och sedan designa och utföra en single cell RNAseq-studie för att identifiera prediktiva markörer och deras biologiska funktion för NES-celler för cellterapi utveckling för stroke. Projektet kommer att omfatta bioinformatik, hypotesformulering, statistik, experimentdesign och planering. Analyserna kommer att inkludera prover och data av bulk RNA-seq, single cell RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq och Proteomics. R och/eller Python kommer att användas.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Huvudarbetsuppgifterna för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning och därför kommer du både vara antagen som student och anställd vid Lunds universitet.

Som doktorand inom forskargruppen arbetar du i ett forskningsprojekt med fokus på humana neurala stamceller och dess potential i att modellera hjärnans utveckling och som cellterapibehandling. I dina arbetsuppgifter ingår huvudsakligen analys av transkriptomdata, inklusive bulk RNAseq och scRNAseq men även epigenetikdata och proteomicsdata. Doktoranden kommer att vara delaktiga i hela processen, från experimentell design, val av sekvenseringsteknologi, processning av rådata samt tolkning och rapportering.

Kvalifikationer

Krav för antagningen är:

Avlagd examen på avancerad nivå, fullgjorda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. God förmåga av att tillgodogöra sig forskarutbildningen och god förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska 

Krav för anställningen är:
-Avslutad Master inom Bioinformatik

-Dokumenterad erfarenhet single-cell sekvenserings analys i R och python

-Dokumenterad erfarenhet av konstruktion av gene regulatory networks med verktyg som CellOracle och Scenic

-Dokumenterad erfarenhet att arbeta i en teammiljö

-God vetenskaplig förmåga att självständigt planera och analysera experiment

-God förmåga att fungera bra i samarbetsprojekt både inom gruppen och med andra forskargrupper samt med andra discipliner

-God förmåga att presentera forskning i tal och skrift

- Att du är strukturerad, noggrann och uthålligt 

-Erfarenhet av analys av scRNAseq från stamceller och cellterapiprodukter

-Erfarenhet av att bedöma och analysera data från litteraturen

-Erfarenhet av transcriptom analyser av cellterapiprocesser

Meriterande för anställningen är:

-erfarenhet av identifiering, bedömning, nedladdning och analys av data från litteraturen

-teoretisk erfarenhet av stamceller och analys av heterogenitet i stamcells differentieringar

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.

Som doktorand vid Lunds universitet är du både antagen som student och anställd vilket ger flera förmåner. Läs mer om att vara antagen och anställd vid på universitetets webbplats.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss

Om anställningen

Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1-7 §§. Bestämmelser gällande antagning till forskarstudier finns i 6 kap. 3 § högskoleförordningen (1993:100). Mer information finns på universitetets hemsida

Övrigt

För doktorander finns en särskild lönestege knuten till varje fakultet och lön sätts enligt aktuell lönestege.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter (max 1 sida). Ansökan ska även innehålla CV (max 2 sidor), examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Bedömningsgrund

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.