biträdande forskare i bioinformatik med inriktning mot urologisk cancer

Beskrivning av arbetsplatsen
Målet med vår forskning är att bättre kunna individanpassa behandlingen för cancerpatienter genom att utveckla nya prognostiska och behandlingsprediktiva tester samt att studera tumörbiologi för att förstå behandlingsresistens och hitta nya måltavlor för behandlingar. För att uppnå detta använder de senaste teknikerna för tumöranalyser, både från vävnad och från blodprover från unika kliniska prover. Dessa kommer bl.a. analyseras med nya tekniker för analys av blodprover (cirkulerande tumörceller, cirkulerande tumör-DNA) och vävnadsprover (genexperessionsanalyser, DNA-sekvensering, single-cell sekvensering, spatial sekvensering etc) där avancerad bioinformatisk dataanalys kommer att vara en av hörnpelarna. Vår forskargrupp har tidigare haft ett fokus på bröstcancer men förstärker nu gruppen med ytterligare fokus på urologisk cancer, särskilt prostatacancer. Forskningen sker i nära samarbete med andra prekliniska och kliniska urologiska cancerforskare och det finns utmärkta möjligheter att använda core facilities vid Lunds universitet och stor vikt läggs vid personlig utveckling av gruppmedlemmarna. Forskningsgruppen finns lokaliserad vid Medicon Village i Lund med direkt närhet till många av de tekniker vi använder och våra samarbetspartners.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Den framgångsrika kandidaten kommer i samarbete med gruppens preklinska och kliniska forskare att självständigt planera, genomföra och redovisa forskningsprojekt inom precisionsmedicin för urologisk cancer och arbeta mot gruppens gemensamma mål om förbättrad individanpassad behandling för patienter med cancer. Särskilt kommer kandidaten att ansvara för dataanalys och bioinformatik för att utveckla nästa generations blodbaserade biomarkörteknologi baserat på t.ex. epigenomisk sekvensering och analys av fragmenteringsmönster av cell-fritt DNA. Andra projekt kommer att studera hur mikromiljön styr tumörutveckling och behandlingsresistens genom att använda nya single-cell och spatial transcriptomics tekniker. I arbetsuppgifterna ingår även att upprätta och administrera nödvändig datainfrastruktur inklusive servrar. Kandidaten förväntas även handleda studenter, presentera forskningen vid nationella och internationella konferenser samt att under handledning ansöka om forskningsfinansiering.

Kvalifikationer
Krav för anställningen är:

• Forskarutbildning inom medicin, biologi eller datavetenskap
• Minst 2 års postdoktorsvistelse med inriktning mot bioinformatik eller dataanalys inom cancerforskning
• Grundläggande programmeringskunskaper i relevant språk som R eller Python
• God förmåga att kommunicera i tal och skrift på engelska

Meriterande för anställningen är:

• Kurser inom bioinformatik, datavetenskap och programmering
• Kurser inom urologisk cancerforskning
• Erfarenhet av bioinformatisk analys av flera -omics tekniker, särskilt single-cell analys, av urologisk cancer
• Erfarenhet av att sätta upp och administrera infrastruktur för beräkningsbiologi inkl. systemadminstration av servrar och datorkluster.
• Erfarenhet av programmering, särskilt för maskininlärning och artificiell intelligens
• Erfarenhet av att skapa egen mjukvara för vetenskapliga ändamål.
• Erfarenhet av vetenskaplig publicering
• Erfarenhet av att söka och erhålla forskningsanslag i konkurrens

Övrigt
Anställningen är en SÄVA (särskild visstidsanställning) på 100 % under perioden 2024-11-14 till 2025-11-13. Önskat startdatum är den 14 november 2024, eller enligt överenskommelse.

Så här söker du
Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)

Varmt välkommen med din ansökan!