Postdoktor i Växters epigenetik

Särskild ämnesbeskrivning

Växter har en fantastisk förmåga att reagera på miljöutmaningar genom intracellulär reglering av sina funktioner. Medan mycket fokus har legat på de gener som kodar för proteiner, är växtgenomerna enorma och innehåller till stor del icke-kodande DNA med oklara funktionella roller för cellerna. Vår tidigare forskning visade hur växternas icke-kodande genom bidrar till cellulära motståndskraftsmekanismer genom produktion av icke-kodande RNA-molekyler eller genom kromatinsignaturer som korrelerar med ncRNA-produktion.

Vi söker en postdoktor som är entusiastisk över mekanistisk växtmolekylärbiologi inom detta område. Specifikt för att ta itu med frågan om hur kromatinsignaturer kopplade till ncRNA-produktion kan hämma geninduktion (DOI: 10.1016/j.tplants.2020.03.005 , DOI: 10.1371/journal.pgen.1007969). Som utgångspunkt har vi mutanter som stör denna mekanism för vidare forskning. Dessutom är en viktig aspekt av detta projekt metoder för ”Epigenome Engineering”. Dessa bygger på riktad rekrytering av histonmodifierande enzymer till platser där genrepression genom kromatinsignalering av icke-kodande fungerar.

Här kommer vi att använda NGS-kromatinmetoder (t.ex. ChIP-seq, CUT&Tag, CUT&Run) för att analysera genomomfattande såväl som riktade effekter av lokusspecifik epigenomteknik. En stark kunskap om kromatinbiologi, på bänken såväl som på datorn för dataanalys av Next-Generation Sequencing, kommer att vara till stor hjälp för projektets slutförande. Forskningsaktiviteterna i laboratoriet inkluderar också RNA-biologi, denna anställning fokuserar på forskningsområdet växtepigenetik (inklusive epigenomisk dataanalys). Targeted Epigenome Engineering representerar ett relativt nytt forskningsområde, så postdoktoral utbildning inom detta område lovar framtida möjligheter. Internationella forskningsbesök på samarbetande laboratorier är en möjlighet för att stärka postdoktorns internationella nätverk.  Det kommer att finnas en blandning av deltaganden: 1.) i pågående aktiviteter där slutförandet är relativt nära, och 2.) i initiativ med stor frihet att driva utvecklingen självständigt.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Arbetsuppgifterna innefattar även (ex.):

• Forskning inom växtepigenetik
• Undervisning under första, andra och tredje studiecykeln
• Handledning av examensarbeten och doktorander
• Aktivt söka extern forskningsfinansiering
• Administration relaterad till de arbetsuppgifter som anges ovan

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Utmärkt förmåga att utveckla och genomföra nyfikenhetsdriven forskning av hög kvalitet.
• Dokumenterad skicklighet i Next-Generation sekvenseringsanalyser.
• Dokumenterad erfarenhet av analys av Next-Generation sekvenseringsdata till exempel med hjälp av högpresterande databehandling, R och python.
• Stark bakgrund inom molekylär växtbiologi, särskilt epigenetik.
• Starkt engagemang för grundläggande växtbiologisk forskning.

Bedömningsgrunder
Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• Utmärkt förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

• Intresse och passion för det beskrivna forskningsprojektet inom växtepigenetik
• Kunskap om metoder för epigenomteknik
• Kompetens inom dataanalys av nästa generations sekvensering
• Förmåga att hantera och hantera stora datamängder
• Självmotivation
• Uthållighet
• Resultatinriktning med målet att slutföra projekt för publicering

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max 2 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.