Lunds universitet, institutionen för astronomi och teoretisk fysik

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.

Ettårig forskartjänst inom beräkningsbiologi med inriktning mot svampars nedbrytning av markorganiska föreningar

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Forskningsuppgifterna omfattar analyser av transkriptom som uttrycks vid svampars nedbrytning av markorganiska föreningar. Syftet med projektet är att identifiera de gener och genetiska nätverk som kontrollerar ektomykorrhizasvampars nedbrytning av organiska föreningar (t.ex. cellulosa, pektin, protein, kitin). Nedbrytningsprocessen följs i detalj över tiden med spektroskopiska metoder (främst FTIR och XPS) och transkriptomanalyser baserat på RNA seq-data. Statistiska metoder och maskinlärningsverktyg kommer att användas för att identifiera moduler av koreglerade gener som uttrycks under olika faser av nedbrytningen. För att förstå funktionen av dessa moduler så kommer deras uttryck att kopplas till svampens extracellulära nedbrytningsaktivitet och den predikterade funktionen av gener baserad på annotering av gener i svampar.

Forskaren kommer att ingå i Carl Troeins grupp och jobba nära Professor Anders Tunlid och Per Perssons grupp på biologiska institutionen, och dessutom vara en del av det multidisciplinära forskningsprogrammet “Molecular Interactions Controlling soil Carbon Sequestration – MICCS”. Det övergripande målet med forskningsprogrammet MICCS är att erhålla mekanistisk förståelse för hur markorganiska föreningars interaktioner, aktiviteten hos nedbrytande mikroorganismer och den fysikaliska-kemiska miljön påverkar de markorganiska föreningarnas stabilitet. Forskningsmiljön MICCS består av en stark grupp forskare, forskningsingenjörer, postdoktorer och doktorander som studerar markorganiska föreningar på olika grader av komplexitet och spatiell upplösning – från definierade modellsystem till fältstudier – med hjälp av modern teknologi såsom spektroskopiska metoder, transkriptomanalys, isotopinmärkning och systembiologi. För ytterligare information se http://miccs.info/.

Kvalifikationer

Följande är krav:

  • Postdoktoral erfarenhet av statistiska analyser av transkriptomdata från ektomykorrhizasvampar som bryter ner markorganiska föreningar
  • Dokumenterad erfarenhet av analyser av RNA seq-data från tidsserier omfattande identifiering av funktionellt kopplade, koreglerade genmoduler.
  • Flytande engelska (i skrift och tal)

Följande är meriterande:

  • Förmågan att utföra forskningsuppgifter både självständigt och som en del av en forskningsgrupp

Ansökningsförfarande

Ansökan ska innehålla följande delar:

  • CV inkluderande kopia av PhD-diplom, avhandlingens titel, tidigare anställningar, nuvarande anställning och akademiska utmärkelser (max. två sidor)
  • Fullständig publikationslista
  • Kort beskrivning av pågående forskning (max. en sida)
  • Namn och kontaktinformation på minst 3 referenspersoner.

Anställningsform Tidsbegränsad anställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Så snart som möjligt i ett år
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2018/914
Kontakt
  • Mattias Ohlsson, universitetslektor, 046-222 7782, mattias.ohlsson@thep.lu.se
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
Publicerat 2018-03-21
Sista ansökningsdag 2018-04-04

Tillbaka till lediga jobb