Postdoktor i fysikalisk kemi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Särskild ämnesbeskrivning

Målet med projektet är att utföra coarse grain simuleringar av protein som binder över cellkontakter. Detta ligger till grunden för hur vårt immunförsvar aktiveras när det möter främmande smittoämnen och hur det kan skilja mellan våra egna celler och t.ex. bakterier och virus. Simuleringarna kommer specifikt användas för att bättre förstå observationer som nyligen gjorts av oss och kollegor när det gäller bindning i kontakten mellan en T-cell och ett modellsystem för en cellyta som kallas SLB (se t.ex. Junghans et al. doi: 10.1242/jcs.245985).

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Initialt i projektet kommer en simuleringsmodel utvecklas för coarse grain simuleringar av protein som binder i kontakten mellan ett SLB och en cell. Detta kommer sedan användas till att studera:

• Bindning vid olika proteintäthet i SLBet och hur detta beror på om det finns ytterligare molekyler i kontakten som kan binda.
• Hur blandningar av olika protein (med olika längd, täthet, och bindningsaffinitet) påverkar bindningen.
• Bindning mellan de två proteinerna CD4 och T-cell receptorer till samma cellreceptor (MHC).
• Hur dynamiska, fingerlika strukturer på cellen som kallas mikrovilli påverkar protein-protein bindning.

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Dokumenterad erfarenhet av datorsimuleringar av makromolekylära interaktioner. 

Bedömningsgrunder
Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

• Erfarenhet av datorsimuleringar av proteinbindning över en cellkontakt.
• Erfarenhet av coarse grain simuleringar av protein-protein interaktioner.
• Erfarenhet av molekylsimuleringar (MC/MD) av biologiska membran.
• Kunskap i C/C++ programmering.
• Erfarenhet av avancerad dataanalys (Jupyter notebooks eller liknande).
• Kunnig och intereserad i biologi och immunförsvaret. 

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max 2 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2008-09-04 (Arbetsgivarverket, OFR:s, Saco-S och SEKO).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.