Doktorand i mikrobiologi inom medicinskt område - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av arbetsplatsen

Hauryliuks forskargrupp använder en kombination av mikrobiologiska, biokemiska, kryo-elektronmikroskopiska och genomik-metoder till att studera proteinsyntes. En av forskningsinriktningarna i laboratoriet är studier av toxin-antitoxinsystem (TA-system) i bakterier och bakteriofager. De TA-toxiner som upptäckts i laboratoriet är så kallade toxSAS-enzymer som hämmar bakterietillväxt antingen genom att producera giftiga nukleotider [1] eller genom att modifiera tRNA [2]. Forskargruppen har även visat att toxSAS-innehållande TA-system kan fungera som bakteriella immunsystem vilka skyddar bakterierna från bakteriofaginfektioner [3]. Doktorandprojektet kommer att fokusera på att upptäcka tidigare okända TA-baserade fagförsvarssystem samt att utröna deras molekylära mekanism. Eftersom fagterapi är ett alternativ till antibiotikabehandling är förståelsen av fagförsvarssystemen av klinisk relevans, dvs. det är viktigt att förstå mekanismer som motverkar fagterapins effektivitet.

Vi söker en doktorand på heltid för att driva experimentellt arbete inom vårt explorativa toxin-antitoxinforskningsprogram. I vår grupp strävar vi efter en stödjande, respektfull och stimulerande arbetsmiljö som främjar personlig och professionell utveckling för alla medarbetare. Hauryliuks forskargrupp är välutrustad och samarbetar med ledande forskargrupper i både Europa och USA. Startdatum är enligt överenskommelse.

Referenser

1. Jimmy S. et al. Proc Natl Acad Sci U S A 117, 10500-10510, (2020)
2. Kurata T. et al. Molecular Cell 81, 3160-3170 e3169, (2021)
3. Zhang T. et al. Nature 612(7938):132-140 (2022)

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss | Lunds universitet

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Projektet kommer i huvudsak fokusera på toxin-antitoxinsystem. Potentiella TA-system som identifierats med hjälp av bioinformatikverktyg (t.ex. djupinlärning för strukturell förutsägelse som AlphaFold2) kommer att valideras experimentellt med hjälp av mikrobiologiska analyser. Deras toxicitetsmekanism kommer att undersökas med hjälp av mikrobiologiska och biokemiska metoder inklusive metabolisk isotopmärkning, biokemiska analyser, RNASeq/5Pseq och genetisk ’screening’ för suppressormutationer. Den potentiella rollen av TA-systemen i fagförsvar kommer testas experimentellt genom bakteriofaginfektioner av relevanta bakterier. Du kommer också̊ att ha möjlighet att studera andra molekylära system, t.ex. ribosom-associerade hjälparproteiner involverade i proteinsyntes och antibiotikaresistens.

Du kommer även få möjlighet att delta och presentera ditt arbete på internationella möten och konferenser.

Även andra förekommande arbetsuppgifter i forskargruppen kan bli aktuella.

Kvalifikationer

För tjänsten krävs:
• Erfarenhet av molekylärbiologiska och mikrobiologiska tekniker
• Erfarenhet av arbete med bakteriofager
• Erfarenhet av rekombinant DNA teknik
• Bakgrundskunskaper inom och intresse för molekylärbiologi, biokemi och genetik
• Goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Tjänsten kräver att du har problemlösningsförmåga samt god analytisk förmåga och samarbetförmåga.

Meriterande för tjänsten är:

• Erfarenhet av protein biokemi och/eller RNA biokemi och/eller strukturbiologi
• Erfarenhet av biokemiska och mikrobiologiska analyser av toxin-antitoxin system

Så här söker du

Inkludera i din ansökan:

1. Ett följebrev (max 1 sida) med följande avsnitt:
2. i) Motivation: Förklara ditt intresse för projektet, motivation för att söka och vad du hoppas kunna lära dig
3. ii) Behörighet och erfarenhet: Förklara hur du uppfyller behörighets- och kvalifikationskraven, beskriv din tidigare relevanta erfarenhet och beskriv hur du kommer att bidra till forskargruppen.
4. Ett fullständigt CV med kontaktuppgifter för två referenser
5. Certifikat av kandidatexamen och magisterexamen

För mer information kontakta Vasili Hauryliuk vasili.hauryliuk@med.lu.se or Marcus Johansson marcus.johansson@med.lu.se.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Bedömningsgrund

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.