Doktorand i biologi

Ämnesbeskrivning

Biologi är det stora ämnet om allt levande. Det spänner över allt från processer på molekylär och cellulär nivå̊ till globala processer på ekosystemnivå. Detta omfattande ämne indelas i ett antal mindre discipliner och ämnesinriktningar. Forskarutbildningen vid biologiska institutionen omfattar många av dessa inriktningar, från molekylärbiologi till tillämpad ekologi, från virus och enskilda celler till evolutionsbiologi och global biodiversitet. Att forskarutbilda sig vid biologiska institutionen innebär i regel en specialisering inom någon mer avgränsad del av hela biologins forskningsfält och kan omfatta fältarbeten, experiment, teoretiskt arbete, eller en kombination av dessa.

Arbetsuppgifter

Huvuduppgiften för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan det även ingå medverkan i undervisning och annat institutionsarbete, dock max 20% av arbetstiden.

Forskningsprojektet kommer att undersöka den genomiska komplexiteten hos cyanobakterien Microcystis, som utgör en hälso- och miljöfara eftersom den producerar gifter vid algblomning i sjöar över hela världen. Projektet syftar till att svara på frågan hur den genetiska diversiteten mellan cyanobacteriella stammar, speciellt den kopplad till produktion av alggift, bildats och bibehålls i sjöarnas ekosystem. Kandidaten till doktorandtjänsten kommer huvudsakligen fokusera på strukturella genomförändringar och dess dynamik genom att tillämpa innovativa bioinformatiska metoder. Forskningsarbetet kommer också innebära kontrollerade laboratorieexperiment såväl som fältarbete i närliggande sjöar, i samarbete med övriga medlemmar i forskargruppen. Nedströms analyser inkluderar användadet av molekylärbiologiska metoder. Slutligen, doktorandutbildningen inkluderar statistiska analyser, tolkning av forskningsdata, manuskriptskrivande och muntliga presentationer.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har:

• avlagt examen på avancerad nivå eller
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, med innehåll som är relevant för forskarutbildningen eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Kraven på särskild behörighet för biologi uppfyller den som har avklarat ett självständigt arbete (till exempel examensarbete) i relevant ämne omfattande minst 30 högskolepoäng, samt har goda kunskaper i det engelska språket, såväl skriftligt som muntligt.

Övriga krav

• MSc i bioinformatik, biologi eller motsvarande med minst 30 poäng bioinformatik
• Grundläggande kunskaper i ekologi och evolution
• Grundläggande kunskaper av att arbeta på ett våt-laboratorium.
• Utmärkta kunskaper i engelska, både i läsförståelse och skrift.
• Mycket god förmåga till proaktivt och självständigt arbete.

Det är meriterande om kandidaten har:

• Erfarenhet av genomassemblering och annotering
• Erfarenhet av s.k. workflows och reproducerbart arbete
• Flytande i skriptspråk såsom R eller Python
• Erfarenhet av sekvensanalys
• Erfarenhet av att odla mikroorganismer
• Erfarenhet av att genomföra laboratorieexperiment

Bedömningsgrunder

Urval till utbildning på forskarnivå sker efter bedömd förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Bedömningen av förmågan sker främst utifrån studieresultaten på grundnivå och avancerad nivå. Följande beaktas:

• Kunskaper och färdigheter relevanta för avhandlingsarbetet och utbildningsämnet.
• Bedömd förmåga till självständigt arbete och förmåga att formulera och angripa vetenskapliga problem.
• Förmåga till skriftlig och muntlig kommunikation.
• Övriga erfarenheter relevanta för utbildningen på forskarnivå, till exempel yrkeserfarenhet.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, problemlösningsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms ha den förmåga som behövs för att klara forskarutbildningen.

Villkor

Endast den som är antagen till forskarutbildning får anställas som doktorand. Forskarutbildningen är fyra år vid heltidsstudier. Vid undervisning och annat institutionsarbete förlängs anställningen i motsvarande grad, dock längst till 5 år (det vill säga max 20%). Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1–7 §§.

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och ska innehålla:

• Ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av doktorandutbildningen och på vilket sätt forskningsprojektet matchar dina intressen och din utbildningsbakgrund.
• En kort beskrivning (max 250 ord) beskrivande en forskningsfråga som intresserar dig (det behöver inte vara kopplat till detta forskningsområde).
• Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, rekommendationsbrev etcetera).
• Vänligen inkludera minst två referenser med kontaktinformation (telefonnummer och emailadress).