Projektassistent inom spatial singelcellbioinformatik

Beskrivning av arbetsplatsen

Forskningen leds av Catharina Hagerling vid medicinska fakulteten och fokuserar på spridd cancer (metastaser). Ambitionen med forskningen är att identifiera nya behandlingsstrategier för patienter med spridd cancer.

Inom forskargruppen arbetar vi för en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra samt att arbetsplatsen ska vara utvecklande och stimulerande för alla medarbetare.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Analysera spatial singelcelltranskriptomikdata från metastaser. I arbetet ingår följande:

• Dataformatering och kurering: Standardisera rådataformat och kurera datauppsättningar för att säkerställa kompatibilitet och noggrannhet för analys.
• Uteslutning av specifika områden/celler: Identifiera och exkludera irrelevanta eller avvikande dataområden/celler för att fokusera analysen på meningsfulla insikter.
• Datavisualiseringar: Utveckla heltäckande visuella representationer av dataanalysresultat för att underlätta förståelse och praktiska insikter.
• Immunfenotypning: Genomför detaljerad profilering av immunceller i tumörmiljön för att förstå immunsystemets interaktioner och effekter.
• Nischanalys: Undersök mikromiljöer för att avslöja nischspecifik dynamik och effekter.
• Klusteranalys och anteckning: Utför klusteranalys för att identifiera och kommentera betydande cellkluster och grupperingar i data.
• Segmenteringsförbättring: Förbättra datasegmenteringsmetoder efter behov för att förfina datakvaliteten, om det behövs.
• Odla cancerceller.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• Avlagd kandidatexamen eller motsvarande inom bioinformatik, datavetenskap eller biomedicin
• Erfarenhet av bioinformatik och cellodling
• Ha kunskaper och erfarenhet av att analysera spatial singelcelltranskriptomikdata som genererats från plattformen CosMx, Nanostring
• Mycket goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska
• God förmåga att arbeta självständigt
• God samarbetsförmåga

Meriterande för anställningen är:

• Erfarenhet av CRISPR
• Erfarenhet av cellodling

Om anställningen

Anställningen är en särskild visstidsanställning på 100% med startdatum den 19 maj 2025 eller enligt överenskommelse, dock längst till och med den 17 oktober 2025.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan bör innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.