Biträdande forskare i translationell singelcell-genomik

Beskrivning av arbetsplatsen
Centrum för Translationell Genomik är en prioriterad forskningsinfrastruktur vid Medicinska Fakulteten, Lunds Universitet, som även ingår i den nationella Clinical Genomics-plattformen vid SciLifeLab. Clinical Genomics-plattformen erbjuder avancerad genomik-baserad forskningsservice (t.ex. inom singelcell-sekvensering) för translationella och kliniska forskare över hela Sverige, samt bidrar till snabb translation av nya forskningsfynd till klinisk nytta genom ett nära samarbete med hälso- och sjukvården. Enheten är lokaliserad till BMC D14 i Lund och består för närvarande av ett multidisciplinärt team på 14 personer.
Vi söker nu en driven, erfaren och teamorienterad biträdande forskare, som är intresserad av att utveckla och erbjuda forskningsservice i frontlinjen inom singelcellsekvensering och spatiell transkriptomik. Som arbetsplats värnar vi om en positiv arbetsmiljö med respekt och hänsyn i våra relationer med varandra.Som arbetsplats värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Du kommer att bli en del av ett mycket engagerat och erfaret team som fokuserar på att erbjuda forskningsservice i den absoluta frontlinjen inom singelcell-sekvensering och spatiell transkriptomik. Då dessa metoder utgör ett nationellt fokusområde inom SciLifeLab’s Clinical Genomics-plattform, vilket leds av CTG, kommer du även att bidra till att stärka CTG:s roll nationellt. Arbetsuppgifterna kommer att innefatta praktiskt arbete på de senaste singelcells- och sekvenserings-plattformarna (t.ex. NextSeq 2000, NovaSeq X Plus). I rollen ingår också kontinuerligt förbättringsarbete och standardisering av befintliga analysmetoder (t.ex. inom singelcell-applikationer, histologi och mikroskopi), rådgivande möten med forskare eller andra användare av forskningsinfrastrukturen i samband med olika typer av service- och utvecklingsprojekt samt administration av serviceprojekt. Arbetet kommer att vara mycket teamorienterat, både genom interna och externa samarbeten, vilket kräver utmärkt samarbets- och kommunikationsförmåga.

De huvudsakliga arbetsuppgifterna inkluderar:

• att utföra forskningsservice, d.v.s. laborativt arbete, baserat på ledande kommersiella singelcellplattformar (t.ex. iCell8cx, 10X Chromium/ChromiumX, Visium CytAssist, Xenium, CellenONE F1.4)
• utveckling och implementering av nya metoder inom singelcellsekvensering och spatiella vävnadsanalyser
• att utföra ljus- och flourescensmikroskopi av vävnadspreparat (t.ex. med Nikon Ti2)
• erbjuda expertis och rådgivning till forskare och andra användare av faciliteten i samband med service- och utvecklingsprojekt (singelcells- och spatiell vävnadsanalys)
• diverse administrativa uppgifter, såsom dokumentation och rapportering av serviceaktiviteter, upphandling av instrument samt vetenskapligt skrivande.

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

• Doktorsexamen från relevant forskningsområde (t.ex. molekylärbiologi, genomik eller motsvarande)
• Mycket goda kunskaper om, och dokumenterad praktisk erfarenhet av, arbete med den nya generationens sekvenseringsteknologi (NGS).
• Mycket goda kunskaper om, och dokumenterad praktisk erfarenhet av arbete med
  NGS-baserad singelcellanalys och spatiell transkriptomik.
• Minst 5 års praktisk erfarenhet av arbete med molekylärbiologiska metoder (t.ex. cDNA-syntes, PCR/qPCR, RNA/DNA-analys).
• Mycket god muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på engelska

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Du har en god förmåga att snabbt sätta dig in i nya metoder och upprätta nya protokoll. Du har även en utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga samt utför ditt arbete självständigt och med hög kvalitet samtidigt som du uppfyller fastställda tidsfrister. Slutligen har du en utmärkt planerings-, organisations- och prioriteringsförmåga.

Meriterande för anställningen är:

• Erfarenhet av NGS-bibliotekspreparation (t.ex. Illumina DNA Prep, Nextera XT, DLP).
• Erfarenhet av NGS-baserad Illumina-sekvensering (t.ex. NextSeq 2000, NovaSeq 6000, NovaSeq X Plus)
• Erfarenhet av arbete inom kommersiellt tillgängliga plattformar singelcellsekvensering (t.ex. 10X Chromium, inDrop, ParseBiosciences, Singleron)
• Erfarenhet av histologisk vävnadsanalys och fluorescensmikroskopi
• Erfarenhet av cellodling av primära celler och cellinjer
• Erfarenhet av cell- eller cellkärna-isolering via flödescytometri
• Erfarenhet av vävnadssnittning samt konservering och förberedelse av vävnad för histologisk analys
• Erfarenhet av proteinanalys med hjälp av masspektrometri
• Erfarenhet av long-read sekvenseringsteknik och relaterad dataanalys
• Erfarenhet av automatisering av laboratorieprocedurer och vätskehanteringssystem
• Tidigare erfarenhet av projektledning
• God muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på svenska

Övrigt
Anställningen är en tillsvidareanställning på heltid med tillsättning 2025-09-01 eller enligt överenskommelse. Provanställning i 6 månader kan komma att bli aktuell.

Så här söker du
Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller kvalifikationskraven samt varför du är intresserad avanställningen. Ansökan ska även innehålla CV, inklusive publikationslista, en generell beskrivning avtidigare forskningsarbete, kopia av doktorsexamen samt övrigt som du önskar åberopa (kopior avexamensbevis, betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.