Projektassistent i biologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Introduktion
Blomningstid är viktigt för reproduktionsframgång hos annuella växter, inklusive viktiga grödor såsom korn (Hordeum vulgare L). De groende fröna utvecklas till en planta som behöver tillväxa under våren och sommaren för att sedan kunna producera många nya frön på hösten. Om växter väntar för länge med övergången från tillväxtfas till reproduktionsfas kan den drabbas av dåliga väderförhållanden mot slutet av säsongen vilket kan förhindra att de nya fröna mognar. Å andra sidan kan en tidig övergång till reproduktion resultera i att växten får en liten storlek vid blomningen och därmed producerar för lite frön i förhållande till konkurrerande individer. Övergången från tillväxt till reproduktion är av dessa anledningar en av de viktigaste händelserna i livscykeln hos blommande växter och behöver optimeras med avseende på geografiska och miljömässiga faktorer. Växter använder sig av miljöfaktorer såsom dagslängd och temperatur för att styra blomningstiden och detta kontrollsystem har en genetisk bas.

Arbetsuppgifter
I detta projekt kommer vi att studera mutanter av korn med tidigblommande fenotyp. Hittills har de tidigblommande generna mat-a och mat-c identifierats. Uppgiften för projekt-assistenten är att identifiera generna mat-b och mat-e. Vi har tagit fram F2-populationer av mat-b och mat-e som kommer att planteras i växthusen vid Biologiska institutionen. Ungefär 300 plantor kommer att användas och deras fenotyp och genotyp kommer att bestämmas. Det senare med så kallad double-digest restriction-site associated sekvensering (ddRAD-Seq). Den genetiska kartan kommer att jämföras med den fysiska kartan och kandidatgener kommer att sekvenseras från de 49 mat-b och 9 mat-e mutanterna vi har tillgång till. Den gen som innehåller mutationer är den gen vi söker.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• doktorsexamen i molelylär växtbiologi.
• praktisk erfarenhet av molekylära tekniker såsom genotyping-by-sequencing, DNA sekvensering, bioinformatik, kopplingsanalyser, PCR, RNA arbete, kloning, proteinrening, western blot.
• flytande engelska i tal och skrift är av stor vikt liksom publikationer i internationellt erkända vetenskapliga tidskrifter.
• kandidaten ska ha ett starkt intresse i allmän evolutionär ekologi och kunna uppvisa en förmåga att arbeta både självständigt och i samverkan med andra forskare, och assistera med handledning av doktorander och examensarbetare.

Meriterander är:

• praktisk erfarenhet av arbete med korn och kornmutanter
• erfarenhet av arbete med tidigblommande växter

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.