Doktorand i biologi - Flyttningsbeteendets genetik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Projekt beskrivning

Vi vet att flyttningsriktning hos sångfåglar är genetiskt betingat men vilka gener som styr dessa resor är än så länge helt okänt. Nya metoder som gör att man kan undersöka hela arvsmassan hos många individer och smart data-loggrar som gör att vi kan dokumentera flyttnings detaljer, möjliggör sökandet efter de gener som kodar för några av de viktigaste aspekterna av flyttningsresan; riktning, längd och tidsanpassning. Sveriges vanligaste fågel lövsångaren är mycket väl lämpad för sökandet efter flyttningsgener. I sitt vidsträckta utbredningsområde från västligaste Europa till ostligaste Asien, finns tre underarter som har väldigt olika riktningar och längder på sina flyttningsresor.

Arbetsbeskrivning

I detta projekt utnyttjar vi denna variation som erbjuder studier av naturligt förekommande hybrider i flyttningsdelaren i Skandinavien respektive i länderna söder om Östersjön, samt genetiken bakom de gradvisa förändringarna av flyttningsresan längs artens kontinuerliga utbrednings österut genom Asien. Tillgång till ett referensgenom av hög kvalité och att storskalig sekvensering identifierat två regioner (på kromosom ett och fem) som följer utbredningen av två olika flyttningsmönster lägger grunden till det planerade projektet. Detta utgörs av tre delar: (1) undersöka hur flyttningsresans detaljer, dokumenterad med ljus-loggrar, samvarierar med de olika genotyperna på kromosom ett och fem, (2) analysera återkorsade individer med hel-genom sekvensering för att identifiera SNPs som associerar till flyttningsresan samt (3) undersöka hur lövsångarens expansion österut genom Asien sedan den senaste istiden format variationer i arvsmassan och framförallt de gener som kodar för flyttningsresan. Doktoranden kommer att ansvara för provinsamlingen, utföra fältarbetet med ljusloggrar och tillsammans med postdocs i projektet genomföra de bioinformatiska analyserna.

Kvalifikationer

Master i biologi med inriktning mot flyttfågelekologi eller molekylär ekologi. Hög motivation och nyfikenhet på det föreslagna projektet är ett måste, tillika kunskaper om artigenkänning och erfarenheter av fångst och ringmärkning av vilda fåglar. Körkort är ett krav. Vidare krävs god analytisk förmåga samt utmärkt förmåga att uttrycka sig på engelska både skriftligt och muntligt.Erfarenheter av molekylärgenetiskt laboratoriearbete (PCR och sanger-sekvensering), bioinformatiska analyser av storskaliga sekvensdata samt statistiska analyser i R, är i högsta grad önskvärda. Eftersom delar av fältarbetet kommer att utföras i Ryssland kommer förmågan att prata ryska väga tungt till fördel för sökande som annars har likvärdiga meriter. Meriterande är också erfarenheter av att montera ljusloggrar på små tättingar och att analysera och tolka dessa data.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Bedömningsgrund

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.