Lunds universitet, Med fak, Institutionen för laboratoriemedicin

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 40 000 studenter och 7 600 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.

CTG (https://www.ctg.lu.se/) är en prioriterad forskningsinfrastruktur vid Medicinska Fakulteteten vid Lunds Universitet, samfinansierad av Lunds Universitet, Region Skåne och SciLifeLab. Vid centret finns stor expertis inom sekvenserings- och genomikteknologier, och sett både i nationellt och internationellt perspektiv ligger enheten i teknisk framkant med tillgång till mycket kraftfulla sekvenseringsinstrument (t.ex. Illuminas NovaSeq såväl som instrument för långa läsningar, t.ex. Oxford Nanopore GridION) och metoder för single cell-analyser. För beräkningar använder centret ett dedikerat kluster vid Lunds Universitets superdatorcentrum (LUNARC). CTG arbetar nära Centrum för Molekylär Diagnostik (CMD), Region Skåne, i toppmoderna och särskilt anpassade lokaler för att snabbt kunna translatera forskningsfynd till patientnytta i form av klinisk diagnostik. CTG tillsammans med CMD utgör även en facilitet (Clinical Genomics Lund, del av Diagnostics Development-plattformen) inom den nationella forskningsinfrastrukturen SciLifeLab, och är en av de drivande aktörerna inom det nationella sekvenseringsinitiativet Genomic Medicine Sweden (https://genomicmedicine.se/).

CTG har idag ett femtontal anställda med kompetens inom molekylärbiologi, bioinformatik och systemutveckling. Vi söker en Bioinformatiker på heltid till en tillsvidareanställning. Tjänsten beräknas starta i november, eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

Den aktuella tjänsten är ny inom enheten och går att anpassa och utforma tillsammans med operativt ansvarig för enheten. De huvudsakliga arbetsuppgifterna är:

  • Övergripande ansvar för bioinformatiska rutiner och flöden för data från de senaste sekvenseringsteknikerna, inklusive helgenomssekvensering (WGS, korta och långa läsningar), RNA-sekvensering, pan-cancerpaneler och ”single cell”-sekvensering.
  • Stötta forskare vid Lunds Universitet med avancerade bioinformatiska analyser, inklusive experimentell design, dataanalys, tolkning och publikation.
  • Projekthantering/-ledning av sekvenseringsprojekt för kunder inom Lunds Universitet.
  • Utveckling av verktyg och arbetsflöden för bioinformatiska analyser för forskning och för kliniska ändamål.
  • Utbildning och handledning, externt och internt, d.v.s. av andra forskare och av andra medarbetare inom bioinformatik.
  • Möjlighet till egen forskning och/eller kliniskt arbete.
  • Möjlighet att delta i nationella spjutspetssamarbeten inom genomik och bioinformatik, t.ex. via SciLifeLab och det svenska nationella sekvenseringsinitiativet Genomic Medicine Sweden.

Dataanalys och intern projekthantering/-ledning av forskningsprojekt inom CTG är de primära uppgifterna och kommer att genomföras i samarbete med translationella och kliniska forskare vid i första hand Lunds Universitet och inom den regionala sjukvården. Arbetet kan omfatta allt från kortare uppgifter (såsom sammanställning av kvalitetsdata och leverans av rådata) till djupa där du har det övergripande ansvaret för den bioinformatiska aspekten.

Krav

Den sökande ska ha:

  • doktorsexamen inom adekvat ämnesområde (d.v.s. med bioinformatik och genomik som bas) eller motsvarande (minst 4 års) relevant arbetslivserfarenhet eller avancerade studier inom bioinformatik, från näringsliv, sjukvård eller akademi
  • erfarenhet av att arbeta med sekvenseringsdata
  • erfarenhet av att arbeta i terminalbaserad i Linux-miljö och i minst ett script-språk (t.ex. Python, Perl eller R)
  • utmärkt förmåga att
    • kommunicera muntligt och skriftligt på engelska
    • samarbeta och kommunicera
    • strukturera och prioritera i arbetet
    • arbeta självständigt och utveckla arbetssätt, även där befintliga rutiner saknas

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Meriterande

Det är meriterande om den sökande har:

  • dokumenterad ledarskapserfarenhet
  • adekvat erfarenhet av handledning och/eller undervisning
  • utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på svenska

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.


Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2019-11-01
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2019/3381
Kontakt
  • Thoas Fioretos, Forskargruppschef, +46462224595
  • Tilde Lindgren, Personalsamordnare, 046-2220000
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
  • SEKO: Seko Civil, 046-222 93 66
Publicerat 2019-10-14
Sista ansökningsdag 2019-11-30

Tillbaka till lediga jobb