Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 40 000 studenter och 7 600 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Inom institutionens avdelningar värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi söker nu en biträdande forskareinom proteinbioinformatik. Anställningen är på heltid under 1 år enligt centralt avtal om tidsbegränsad anställning som biträdande forskare. Önskat tillträdesdatum är 1 april 2020, eller enligt överenskommelse

Forskargruppen

Proteinstruktur och Bioinformatik-gruppen forskar på genetik och andra varianter samt deras effekt i DNA, RNA och protein, i struktur, funktion och andra nivåer. Vi har upvecklat flera pålitliga metoder för variationeffektprediktion, t.ex. PON-P2 och PON_MMR2 för patogenecitet, PON-Sol och PON-Stab för molekylärä effekter och PON-mt-tRNA och PON-BTK för molekylspecifika prediktioner. Vi använder och utvecklar bioinformatiska metoder för att studera varianter, deras betydelse och relation till
sjukdomar

Arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna är knutna till maskininlärning för att utveckla prediktionsmetoder för tolkning av varianter och analys av stora genomiska datamängder särskilt inom cancer. Det huvudsakliga arbetsområdet sker inom utveckling av prediktionsmetoder samt analys av massiva datamängder.

Kvalifikationer

För anställningen krävs:

  • Doktorerat i datavetenskap, bioinformatik eller relaterat ämne
  • Stor kunskap i bioinformatik
  • Kunskap inom databaser, programmering och statistik
  • Excellent förmåga till kommunikation i tal och skrift
  • Kunskap i biologi, medicin (molekylärbiologi), strukturbiologi, biokemi, eller genetik
  • Expertis i Unix/Linu

Dessutom bör den framgångsrika kandidaten ha erfarenhet inom några av följande områden:

  • Datastrukturer, databaser och dataarkitekturer
  • Kunskap om biomedicinska resurser och infrastrukturer
  • Kompetenser inom medicinsk statistik och statistisk programmering, helst i R
  • Kompetens inom genomisk dataanalys

Meriterande för anställningen:

  • Kunskap inom databaser samt dataanalys
  • Erfarenhet av datastrukturer, databaser samt dataarkitektur
  • Kunskap om biomedicinska databaser och infrastrukturer
  • Kompetens inom medicinsk statistik och statistisk programmering, helst i R
  • Expertis inom dataanalys av genomer

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2020-04-01, eller enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2020/446
Kontakt
  • Maria Palmkron, personalsamordnare, 046-2220000
  • Mauno Vihinen, forskargruppchef, 046-2220000
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
  • SEKO: Seko Civil, 046-222 93 66
Publicerat 2020-02-07
Sista ansökningsdag 2020-03-01

Tillbaka till lediga jobb