Biträdande forskare inom genomisk lungcancerforskning - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för kliniska vetenskaper i Lund (IKVL) är en av sex institutioner vid medicinska fakulteten. Institutionen har ett brett samarbete, såväl inom fakulteten som inom andra enheter vid universitet. IKVL har även ett väl utvecklat samarbete med Skånes universitetssjukhus (SUS) och Region Skåne samt det omgivande samhället och näringslivet. Detta för att främja klinisk och experimentell translationell forskning, utveckling och utbildning.

Inom institutionens avdelningar värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Forskargruppen för bröstcancer och lungcancer
Lungcancer är en vanlig tumörsjukdom med dåliga behandlingsresultat och den cancerform som skördar flest liv i Sverige och globalt. Rökning är den starkaste riskfaktorn för lungcancer men 10-15% av patienterna har aldrig rökt. Lungcancer är en heterogen sjukdom på molekylär nivå. För att förbättra diagnostiken, behandlingen och prognosen i lungcancer behövs en bättre förståelse av tumörspecifika förändringar. Vi undersöker därför samband mellan tumörsjukdomens utveckling/prognos och DNA, RNA och protein mönster. Genom studier av olika subgrupper av lungcancer vill vi identifiera och beskriva förändringar som kan vara relaterade till sjukdomsspridning och identifiera grupper av patienter med bättre eller sämre prognos. Vidare vill vi utveckla nya molekylära metoder för förbättrad diagnostik av lungcancer med mål att bland annat kunna diagnosticera lungcancer i ett tidigare operabelt sjukdomsskede, bättre kunna följa effekten av behandling, samt detektera återfall i ett tidigare skede.

Forskargruppen söker nu en biträdande forskare med specialkompetens inom genomisk lungcancerforskning. Anställningen är tillsvidare på heltid, med föreslaget startdatum 2020-04-01 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter
I anställningen ingår bioinformatiska analyser av genexpressionsdata, DNA sekvensdata (NGS), epigenetisk data, och klinisk sekvensering. Dessutom kommer anställningen omfatta organisatoriskt ansvar för forskningsprojekt, laboratorieansvar, deltagande i translationella kliniska studier, och tät interaktion med sjukvården.

Biträdande forskaren kommer att ansvara för genomförande av forskningsprojekt baserade på olika s.k. high-throughput tekniker som genexpressionsanalys via microarrayer, massive parallell sequencing (DNA/RNA) tekniker, DNA metylering, och metabolomics inom framförallt lungcancer.

Biträdande forskaren kommer självständigt driva forskningsprojekt, experimentellt utveckla/implementera nya NGS baserade metoder, samt erhålla egna forskningsanslag inom fältet.

Handledning av doktorander inom sökandes expertisområde kan komma att utgöra en del av arbetsuppgifterna. Vidare ingår organisatoriskt ansvar i forskargruppen, samt i olika kliniska samarbetsprojekt, som till exempel translationella delar av kliniska studier.

Dokumenterad experimentell genomisk och bioinformatisk kompetens, förmåga att samverka i grupp inom både akademi och sjukvård, och ha en stark vilja att utvecklas inom fältet avseende nya metoder och analyser är viktiga egenskaper.

Kvalifikationer

För anställningen krävs:

• Doktorsexamen fokuserad på genomisk lungcancerforskning där bioinformatisk såväl som experimentell analys av olika typer av högdimensionell genomisk data skall ha varit en tydlig del och resulterat i publikationer.
• Dokumenterad erfarenhet/publikationer avseende bioinformatiska analyser inom lungcancer genomik från avhandlingsarbete eller post doc period.
• Mycket goda experimentella kunskaper i NGS baserade analyser, microaarrayer, DNA metyleringsanalyser, NanoString baserade tekniker, erhållna från ex utveckling och metodoptimeringsprojekt.
• Erfarenhet av kliniska rutinanalyser av tumörvävnad baserade på NGS teknik.
• Erfarenhet och kunskap i histopatologiskt arbete med tumörvävnad i form av både frusen och fixerad vävnad.
• Goda kunskaper i R programmering.
• Förmåga att arbeta självständigt inom projekt.

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du har en god organisatorisk förmåga samt personligt engagemang med god samarbetsförmåga.

Meriterande för anställningen är:

• Kurser/utbildning i statistisk/bioinformatisk programmering med företrädelsevis R.
• Godkända kurser för bihandledarskap är meriterande.
• Sökanden förutsätts aktivt söka egna anslag för forskningsprojekt. Därför kommer omfattning och kvalitet på tidigare vetenskaplig produktion under doktorandtid, samt dokumenterade egna anslag av större storlek efter disputation beaktas som klart meriterande.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.