Doktorand i systemimmunologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Om arbetsplatsen

Systems Immunology Lab söker en nyfiken, driven kandidat med erfarenhet av beräkningsbiologi och human immunologi för en Datadriven Life Sciences (DDLS) doktorandtjänst inom systemimmunologi. Leds av biträdande universitetslektor Camila Consiglio, använder vårt team multiomikteknologier med hög genomströmning och avancerade beräkningsmetoder för att utforska mekanismerna för den mänskliga immunreproduktiva överhörningen.

Projektöversikt: Detta doktorandprojekt kommer att utforska den komplexa interaktionen mellan immun- och reproduktionssystemen, med fokus på hur könshormoner som testosteron och östrogen påverkar immunfunktionen och reproduktiva resultat. Forskningen kommer att undersöka immunreproduktiv överhörning i två kohorter: kvinnor med polycystiskt ovariesyndrom (PCOS) som naturligt har högre testosteronnivåer, och kvinnor som genomgår provrörsbefruktning (IVF). Projektet syftar till att avslöja hur metabola och reproduktiva faktorer påverkar immuniteten, och hur immunsvar påverkar IVF-framgång. I slutändan strävar studien efter att ge en djupare förståelse av det immun-endokrina förhållandet och dess roll i både reproduktion och immunhälsa.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss

Kravprofil
Krav för anställningen är:
• Civilingenjör inom bioinformatik, biomedicin, statistik, kvantitativ biologi eller liknande disciplin eller motsvarande
• Flytande i beräkningsprogrammering, helst med R eller python
• Erfarenhet av beräkningsbiologi/omik dataanalys
• Bakgrundsförståelse för och erfarenhet av immunologisk forskning
• Kunskaper i muntlig och skriftlig kommunikation på engelska
• Stark kommunikations-, presentations- och skrivförmåga
Meriterande för anställningen är:

- Erfarenhet av systemimmunologiska metoder
• Erfarenhet av kuration, förbearbetning och/eller analys av bulk RNAseq, scRNAseq, Olink proteomics eller andra typer av omics data
• Bakgrund i multi-omics integration
• Bekantskap med git och GitHub
• Kännedom om bästa praxis inom reproducerbarhet och öppen vetenskap, såsom användning av behållare
• Erfarenhet av att använda högpresterande datorkluster
Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Uppdragen kräver att du har förmåga att arbeta självständigt samt förmåga att samarbeta väl med andra i forskargruppen och forskare utanför ämnesområdet. Det kräver också att du är tålmodig, detaljorienterad och noggrann.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

I detta doktorandprojekt kommer du att tillämpa systemimmunologiska metoder för att undersöka människans immunreproduktiva överhörning med hjälp av olika högkapacitetsteknologier. Uppdraget omfattar transkriptomisk (bulk och sc-mRNA-seq), epigenomisk (ATACseq, CUT&RUN), proteomisk (Olink analyser) och sammansättnings- och immunfenotypisk profilering (högdimensionell cytometri). Arbetsuppgifter inkluderar datakurering och bearbetning, och sammansättning, redigering och exekvering av beräkningsskript/arbetsflöden. Andra arbetsuppgifter inkluderar projektledning, skrivande av stipendier och manuskript, presentation på nationella och internationella konferenser, deltagande på seminarier, informellt mentorskap för andra anställda samt att arbeta tillsammans med labbmedlemmar och samarbetspartners.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Bedömningsgrund

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.

Övrigt

Anställningen är tidsbegränsad till fyra år på heltid enligt HF 5 kap 7§ med önskat tillträdesdatum 241201 eller enligt överenskommelse.

Så här söker du

Ansökan ska innehålla allt av följande:

• Ett personligt motiveringsbrev på en sida på engelska
• CV, som visar hur du passar denna specifika doktorandtjänst enligt avsnittet "Krav". CV ska innehålla två referenser från tidigare handledare.
• Du bevis på behörighet (MSc-diplom, indikation på MSc-avslutning före startdatum, eller bevis på poäng).