Forskare i landskapsgeonomik

Arbetsuppgifter

Vi rekryterar en forskare till ett projektet ”Utvärdera effekterna av grön infrastruktur på pollinatörers funktionella konnektivitet med hjälp av landskapsgenomik”, finasierat av den strategiska forskningsmiljön BECC ”Biodiversity and Ecosystem services in a Changing Climate”. Projektet syftar till att använda landskapsgenomiska analyser för att utvärdera vikten av grön infrastruktur för genflöde och konnektivitet hos pollinatörer. Arbetsuppgifterna kommer att bestå i att producera och arbeta med helgenomsdata sekvenserad till låg täckningsgrad av genomet och analysera detta med en snake-make pipeline baserad på programmet ANGSD. Dessutom består arbetet i avandcerad landskapsgenomisk analys och simulering för att utröna i vilken utsträckning grön infrastruktur ökar funktionell konnektivitet hos pollinatörer. Projektet kommer att vara baserat i SPeciation, Adaptation and Co-Evolution-gruppen på avdelningen Biodiversitet och evolution vid Biologiska insitutionen, Lunds universitet samt inom BECC-miljön och handledas av lektor Anna Runemark och forskare Maj Rundlöf samt utföras i samarbete med postdoc Isolde van Riemsdijk, Köpenhamns Universitet. 

Arbetsuppgifterna innefattar: 

• Genomföra forsking, inkluderande avancerad landskapsgenomisk analys baserad på helgenomsdata. Specifikt kommer low coverage helgenomsdata produceras och analyseras med ANGSD, och olika landskapsgenomiska scenarion modelleras e.g. i. SLiM.
• Extrahera helgenomsdata, möjligen från små eller degraderade prover, library prep.
• Handledning av studenter/internshipstudenter
• Aktivt deltagande i forskargruppen. Det kommer finnas möjlighet att utveckla mindre oberoende projekt och söka mindre forskningsstipendier för dessa.

Krav för anställningen

• Positionen kräver att den ansökande har en doktorsexamen eller motsvarande internationell examen, inom populationsgenomik, evolutionär genomik, landskapsgenomik eller bevarandegenomik eller i landskapsekologi i kombination med dokumenterade mycket starka kunskaper i kodande i python eller bash utöver R. 
• Dokumenterade omfattande kunskaper i landskapsgenomik eller landskapsekologi i kombination med dokumenterat omfattande kunskaper inom e.g. python, bash eller R.
• Dokumenterad förmåga att publicera forskning av hög kvalitet.
• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift. 
• Körkort som är giltigt för Sverige under hela anställningsperioden vid anställningens start då tjänsten innefattar fältarbete med pollinatörer. 

Meriterande för anställningen

• Kunskaper i snake-make-programmering
• Erfarenhet av att arbeta med ANGSD-pipelinen
• Dokumenterade omfattande kunskaper i landskapsgenomik eller SLiM-modellering
• Erfarenhet av extraktioner av historiskt DNA och/eller av prover med degraderat DNA eller små prover, erfarenhet av library prep
• Erfarenhet av arbete med insekter i en landskaps- eller populationsgenomiskt kontext

Detta är en karriärutvecklingsposition fokuserad på forskning, och den ansökandes karriärsålder kommer att tas i beaktande då meriterna bedöms. Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling. 

Villkor 

Tidsbegränsad anställning: 1år, 2025-05-24 – 2026-05-23.
Anställningens omfattning: 100%
Kontaktperson: Anna Runemark anna.runemark@biol.lu.se

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV, max 2 sidor.
• Publikationslista.
• Ansökningsbrev, max 1 sida.
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Dokumentation på att doktorsexamen uppnåtts vid anställningens start samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.