Doktorand i Integrativ beräkningskemi med intriktning mot Life Science

Ämnesbeskrivning

Kemiska institutionen tillhör både Naturvetenskapliga fakulteten och LTH vid Lunds universitet. Institutionen har en unik styrka i Sverige genom utbildning inom alla områden av kemi och forskning av internationellt ledande forskargrupper, som sträcker sig från grundläggande till tillämpade forskningsområden. Institutionen har också den avancerade instrumentering som krävs för modern molekylär forskning. Institutionen för kemi har cirka 310 anställda, varav cirka 170 är doktorander. Antalet heltidsstudenter inom grundutbildningen är nästan 500.

Vid avdelningen för Beräkningskemi studerar vi statistisk termodynamik, suspensiondynamik och kvantkemi. Även om vi har ett starkt fokus på grundforskning och modellutveckling, har våra metoder tillämpats på en mängd olika system, såsom life science, lera, cement, havsvatten, dentala miljöer, träfibrer, sand och mejeriprodukter! Vi har även ett välutrustat experimentellt laboratorium för att förbereda proteinprover och genomföra fysikalisk-kemiska mätningar. Dessutom har vi tillgång till en ny BioSAXS: https://www.compchem.lu.se/the-biosaxs-instrument/.

Marie Skepö är professor i Teoretisk kemi och Excellent Teacher Practitioner vid Naturvetenskapliga fakulteten, LU, Sverige. Hennes bakgrund är inom ytkemi och kolloidkemi, och hon har en doktorsexamen i fysikalisk kemi från LU. Hennes primära forskning fokuserar på intrinsically disordered proteins och biomolekylära interaktioner – från bulkfas till ytkontakt. De huvudsakliga teknikerna är atomistiska och grovkorniga molekyldynamiska simuleringar i kombination med biofysikaliska lösnings- och ytadsorptionstekniker, såsom röntgen och neutronspridning.

Skepös forskargrupp består för närvarande av tre doktorander och två postdoktorer, medan ytterligare två doktorander och en postdoktor kommer att börja 2025. Årligen handleder Skepö även två till tre master-/sommarprojektstudenter. Skepö har varit huvudhandledare för åtta doktorander som har disputerat och har handlett åtta postdoktorer. För mer information, se: https://www.teokem.lu.se/people/seniors/skepoe/#/.

Arbetsuppgifter

Projektets titel är: Strukturella och dynamiska insikter i cancerproteiner: Främjande av precisionsmedicin genom integrativa metoder. Detta projekt syftar till att utbilda nästa generation av livsvetare genom att erbjuda studenten en möjlighet att arbeta med banbrytande beräknings  och experimentella tekniker. Projektets tvärvetenskapliga natur, som kombinerar strukturbiologi, datavetenskap och beräkningsmodellering, ligger helt i linje med de framväxande trenderna inom datadriven livsvetenskap. Studenten kommer att utveckla expertis inom både experimentella och beräkningsmässiga områden, lära sig att tillämpa avancerade datavetenskapliga metoder på biologiska problem och samtidigt få insikt i de molekylära mekanismer som styr cellulära processer.

Huvuduppgiften för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan det även ingå/ingår det även medverkan i undervisning och annat institutionsarbete, dock max 20 % av arbetstiden.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har

• avlagt examen på avancerad nivå eller
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, med innehåll som är relevant för forskarutbildningen eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Kraven på särskild behörighet för beräkningskemi uppfyller den som har:

• Minst 120 högskolepoäng kemikurser varav minst 30 högskolepoäng examensarbete på avancerad nivå inom beräkningskemi eller närbesläktade inriktningar. För beräkningskemi godkänns även 60 högskolepoäng fysik och 60 högskolepoäng matematik. Den särskilda behörigheten kan också ha erhållits genom annan motsvarande relevant utbildning, vilket prövas i varje enskilt fall.

Övriga krav:

• Mycket god muntlig och skriftlig färdighet i engelska.
• Kurser i fysikalisk kemi, spridningstekniker, yt och kolloidkemi, statistisk termodynamik, proteinkemi, biokemi, biofysikalisk kemi, matematik och programmering är en fördel.
• Mycket god kunskap om atomistiska molekyldynamiska simuleringar.
• Erfarenhet av att analysera spridningsdata.
• Tidigare praktisk erfarenhet av lågvinkelröntgenspridning och synkrotronstrålningscirkulär dikroism av oordnade proteiner.

Bedömningsgrunder

Urval till utbildning på forskarnivå sker efter bedömd förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Bedömningen av förmågan sker främst utifrån studieresultaten på grundnivå och avancerad nivå. Följande beaktas:

1. Kunskaper och färdigheter relevanta för avhandlingsarbetet och utbildningsämnet.
2. Bedömd förmåga till självständigt arbete och förmåga att formulera och angripa vetenskapliga problem.
3. Förmåga till skriftlig och muntlig kommunikation.
4. Övriga erfarenheter relevanta för utbildningen på forskarnivå, t ex yrkeserfarenhet.

Övriga meriter:

• Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms ha den förmåga som behövs för att klara forskarutbildningen.

Villkor

Endast den som är antagen till forskarutbildning får anställas som doktorand. Forskarutbildningen är fyra år vid heltidsstudier. Vid undervisning och annat institutionsarbete förlängs anställningen i motsvarande grad, dock längst till 5 år (dvs. max 20 %). Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1-7 §§.

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska. Ansökan ska innehålla personligt brev (1/2 A4-sida) med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt forskningsprojektet matchar dina intressen och din utbildningsbakgrund. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).