Projektassistent vid enheten för systemvirologi

Beskrivning av arbetsplatsen 
Gruppen för systemvirologi är placerad vid institutionen för translationell medicin och leds av docent Joakim Esbjörnsson. Gruppen använder olika bioinformatiska och phylogenetiska metoder för att kombinera genetiska, kliniska och epidemiologiska data för att förklara hur virus evolverar och anpassar sig till nya miljöer – såväl på populationsnivå som i enskilda individer. Dessutom används olika experimentella modellsystem för att detaljstudera hur virus-värdinteraktioner reglerar sjukdomsprogression. Forskningen är därför ofta baserad på komplex och mångfacetterad (ofta longitudinellt insamlad) data som kräver avancerad biostatistik och modellering. Dessutom utvärderas identifierade nyckelmarkörer och regulatorer för sjukdomsprogression, och deras potential som behandlings- eller vaccinmål, funktionellt i olika humana cell- och vävnadsmodellsystem. Här kan du läsa mer om vår spännande forskning: 

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi strävar efter en arbetsplats som upplevs som utvecklande och stimulerande för alla medarbetare, och vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare. Vi värnar både om den fysiska säkerheten och psykosociala arbetsmiljön.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Analys av HIV-1 virusevolution och selektion, samt hur virus anpassning till värden associerar med HIV-1 subtyp och sjukdomsprogression. Detta görs genom s.k. maximum-likelihood och Bayesiansk fylogeni och fylodynamik (state-of-the-art), samt avancerad biostatistik i R. Först krävs dock bearbetning av rådata, bl.a. genom djuplodande analys av förekomst av olika rekombinanta varianter av HIV-1 (vilka måste sorteras bort innan fylogenetisk analys kan göras eftersom de bryter mot de evolutionära antaganden som görs vid urval av passande substitutionsmodell).

Fylogenetisk och bioinformatisk analys av data sammanställs i rapporter och slutligen genom författande av manuskript som skickas in till vetenskapliga tidskrifter för granskning och publicering. Under anställningsperioden förväntas även aktivt deltagande i gruppmöten och projektpresentationer (detta inkluderar även egna presentationer).

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

• Erfarenhet av relevant evolutionsbiologi (främst virusevolution och selektionsprocesser), och fylogenetisk sekvensanalys (hantering och analys av sekvensdataset insamlade från longitudinella provserier). 
• Kunskap om virus-värd-interaktioner, immunologi och hur detta relaterar till sjukdomsutveckling.
• Erfarenhet av biostatistisk analys och programmering i R.
• Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du är självständig, driven, och samarbetsvillig.

Meriterande för anställningen är:

• Publikationer i välrenommerade tidskrifter inom ämnet virologi.

Övrigt
Anställningen är en särskild visstidsanställning (SÄVA) under perioden 2025-04-01 till och med 2025-10-31. Omfattning 100 %. 

Så här söker du
Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)