Postdoktor i tumörbiologi

Beskrivning av arbetsplatsen

Forskargruppen, ledd av universitetslektor Charlotte Rolny, bedriver experimentell och translationell forskning med fokus på solida tumörer. Vi är en del av Lunds universitets cancercentrum vid Medicon Village och tillhör Enheten för translationell cancerforskning inom Institutionen för laboratoriemedicin.

Vi söker en mycket motiverad postdoktor med expertis inom bioinformatik. Målet är att identifiera gensignaturer som kan förutsäga behandlingssvar samt att upptäcka nya terapeutiska måltavlor för att omprogrammera tumörassocierade makrofager (TAMs)—immunceller som spelar en nyckelroll i tumörens mikromiljö. Forskargruppen har under flera år arbetat med att omprogrammera TAMs från ett tumörfrämjande till ett tumörhämmande tillstånd som en potentiell behandling. En nyligen identifierad signalväg av Rolny och kollegor, som styr TAMs tumörfrämjande funktioner, har öppnat nya möjligheter för riktad immunterapi. Projektet har ett starkt translationellt fokus, där terapeutiska strategier ska valideras i patientmaterial för att säkerställa klinisk relevans.

Exempel på hur forskningen bedrivs finns här:

https://www.tcr.lu.se/research-groups/immuno-oncology-group

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38041815/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37142795/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33077599/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27197153/

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss. 

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Projektet har ett särskilt fokus på bioinformatisk analys av data från experimentella modellsystem och patientmaterial, men arbetsuppgifterna kan komma att breddas beroende på projektets utveckling. Postdoktorn förväntas delta aktivt i seminarier, gruppmöten och andra relevanta forskningsaktiviteter samt regelbundet presentera projektets framsteg i enlighet med den övergripande projektplanen.

Som postdoktor kommer du att:

• Identifiera nya målriktade terapier som omprogrammerar makrofager till ett tumörhämmande tillstånd.
• Kartlägga makrofagspecifika gensignaturer kopplade till patientöverlevnad, behandlingssvar och återfall.
• Definiera signaturer i tumörmikromiljön med potential att förutsäga behandlingsutfall.
• Utföra omics-dataanalys för att identifiera relevanta nedströmsmål.
• Etablera och upprätthålla samarbeten med kollegor för stöd i dataanalys och tolkning av forskningsresultat.

Huvudsakliga arbetsuppgifter

• Utveckla beräknings- och analyspipelines för spatial transkriptomik och multiplexavbildning.
• Integrera bildbaserade spatiala data med transkriptomik och andra multi-omikdata för fördjupad biologisk förståelse.
• Samarbeta nära med experimentella biologer, kliniker och dataforskare.
• Designa, testa och optimera verktyg för visualisering av spatiala och single-cell-data.
• Bidra till manusförfattande, konferenspresentationer och ansökningar om forskningsmedel.
• Upprätthålla väldokumenterad och reproducerbar kod samt dela data/verktyg när det är lämpligt.

Kvalifikationer
Krav för anställningen:

• Doktorsexamen i bioinformatik, beräkningsbiologi eller annat närliggande kvantitativt område.
• Dokumenterad erfarenhet av analys av spatial transkriptom.
• Erfarenhet av att arbeta med multiplex-avbildningstekniker.
• Goda programmeringskunskaper i minst ett vetenskapligt programmeringsspråk.
• Gedigen förståelse för statistiska metoder, maskininlärning och/eller bildanalys-pipelines.
• Mycket god förmåga att kommunicera skriftligt och muntligt.
• Dokumenterad publikationslista som visar förmåga att bedriva och sprida självständig forskning.

Meriterande kvalifikationer:

• Erfarenhet av att integrera multimodala omikdata (single-cell RNA-seq + spatial + imaging + proteomik).
• Det ses som en merit om du har erfarenhet av laboratoriearbete, särskilt med tekniker som multiplexfärgning och spatial transkriptomik.

Övrigt

Anställningen är tidsbegränsad till två år med möjlighet till förläning med ett extra år, dvs upp till 3 år totalt med önskat tillträdesdatum 2026-02-01 eller enligt överenskommelse.

Behörighet


För att vara behörig att anställas som postdoktor måste den sökande avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom ett ämnesområde relevant för anställningen (dvs biologi, biomedicin, medicin, kemi). Examen ska ha avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller kvalifikationskraven samt varför du är intresserad av anställningen. Ansökan ska även innehålla CV, inklusive publikationslista, en generell beskrivning av tidigare forskningsarbete, kopia av doktorsexamen samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av examensbevis, betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).