Postdoktor i sinnesbiologi: ryggradslösa djurs syn, scRNA-seq - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Särskild ämnesbeskrivning

Denna tvååriga ERC-finansierade postdoktorala tjänst innebär att etablera single-cell -transkriptomiska atlaser för ögon och optiska lober hos tre evertebrater med unikt och avancerat färg- och polarisationsseende: mantisräkor, vattenloppor och eldflugebläckfiskar. Dessa arter har valts för att undersöka evolutionen av avancerad syn, såsom färg- och polarisationsdiskriminering, på cellulär och molekylär nivå. Projektet kommer att knyta an till ett bredare forskningsprojekt, som syftar till att kartlägga organisationen av de nervkretsar som styr syn, hur de formas av miljön samt hur de styr beteenden som navigation, jakt och kommunikation.

Kandidaten kommer att samla in och bearbeta vävnad från retina och optiska lober från varje djur. Därefter kommer hen att arbeta tillsammans med kollegor i Lund och internationella samarbetspartners för att etablera single-cell eller single-nucleus RNA-seq transcriptomic sequencing pipelines. Med hjälp av bioinformatiska metoder kommer kandidaten att analysera genererad data, samt använda in situ-hybridisering (inklusive HCR) för att lokalisera celltyper av intresse i ögonen och synloberna. Dessa data kommer att jämföras med närbesläktade modellarter med mindre komplexa ögon.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock högst en femtedel av arbetstiden. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Arbetsuppgifterna innefattar även (ex.):

• Forskning inom NGS (next-generation sequencing), bioinformatik och synekologi hos evertebrater. Den framgångsrika kandidaten kommer att arbeta heltid med det ovan beskrivna forskningsprojektet. Det förväntas att hen aktivt och kreativt utvecklar samt optimerar de detaljerade metoder som krävs för att uppnå projektets övergripande mål.
• Allt arbete kommer att utföras inom ett samarbetande forskarteam, vilket kräver delning av expertis, öppna diskussioner om resultat samt att underlätta experiment för andra medlemmar.
• Aktivt deltagande i internationella konferenser förväntas, liksom spridning av resultat i peer review-granskade publikationer.
• Även om det inte är huvudfokus för tjänsten kan undervisning på masternivå (föreläsningar, handledning) förekomma, med innehåll inom neurobiologi och sinnesbiologi.
• Handledning av examensarbeten och doktorander.
• Aktivt söka extern forskningsfinansiering med målet att övergå till en självständig forskare efter projektets avslut.
• Utåtriktade aktiviteter för att kommunicera med det omgivande samhället.
• Administration kopplat till arbetsuppgifterna ovan

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga krav:

• Doktorsexamen inom biologi eller närliggande ämnesområden relevanta för projektet (bioinformatik, molekylärbiologi, cellbiologi), avlagd högst tre år före beslut om anställning.
• Dokumenterad kunskap och erfarenhet av:
  • etableringen av metoder för single-cell RNA-sekvensering för icke-modellorganismer bland ryggradslösa djur.
  • bioinformatiska analys pipelines (inklusive programmeringserfarenhet) för att skapa single-cell-transkriptomiska atlaser
  • genommonteringsmetoder
  • molekylära tekniker, inklusive in situ-hybridisering
• Kunskap inom evertebraters synekologi, sinnesbiologi och neurobiologi.
• Kandidaten ska vara mycket motiverad och villig att ta sig an utmanande problem.
• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.

Bedömningsgrunder
Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga meriter:

• Dokumenterad förmåga att arbeta självständigt i forskning i linje med ovanstående arbetsuppgifter och kvalifikationer.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max 2 år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.