BMA/Laboratorie-/Forskningsingenjör till Centrum för Translationell Genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Forskargruppen
Centrum för Translationell Genomik (CTG) är en prioriterad forskningsinfrastruktur vid Medicinska fakulteteten, Lunds universitet, som ingår i Clinical Genomics-plattformen inom SciLifeLab. Denna syftar bl.a. till att erbjuda translationella och kliniska forskare tillgång till toppmoderna analysmetoder inom genomik och transkriptomik (t.ex. WGS, RNA-seq och nya singelcell-analyser) samt till att snabbt omsätta nya forskningsfynd till klinisk nytta i nära samarbete med hälso- och sjukvården. Lokalt sker detta i tät samverkan med Sektionen för Molekylär Diagnostik vid Region Skåne. Inom CTG finns stor expertis inom den Nya Generationens Sekvenseringsteknologi (NGS), bioinformatik och en rad olika sjukdomsområden, och sett både i ett nationellt och internationellt perspektiv ligger enheten i teknisk framkant med tillgång till mycket kraftfulla sekvenseringsinstrument (t.ex. Illumina NovaSeq 6000). För databearbetning använder centrat ett dedikerat beräkningskluster vid Lunds Universitet.

Som en del i sitt nationella uppdrag ingår CTG och Clinical Genomics Lund även i ett nationellt samarbete för precisionsmedicin; Genomic Medicine Sweden, där utveckling av nya metoder för morgondagens forskning och diagnostik till stor del samordnas med motsvarande sekvenseringsenheter vid landets övriga universitetssjukhus.

Vi söker nu en driven, kunnig och serviceinriktad laboratoriemedarbetare som vill bidra till att stärka frontlinjeforskning baserad på avancerade genomiska analysmetoder. Anställningen är en tillsvidareanställning (100%) med önskat startdatum den 1 januari eller enligt överenskommelse. Provanställning om 6 månader kan komma att tillämpas. 

Arbetsuppgifter
Du kommer att ingå i ett team av drygt 5 laboratoriemedarbetare, inom vilket du framför allt kommer att fokusera på service till forskningsprojekt i behov av genomiska analysmetoder. Dessa kan utgå från DNA från både human vävnad och från mikroorganismer och vara både breda (t.ex. helgenomsekvensering) och riktade (t.ex. genpanelsekvensering baserad på ”hybrid-capture”-protokoll). 

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är:

• projektplanering och praktiskt utförande - d.v.s. bibliotekspreparering och sekvensering - av förekommande metoder inom CTG:s genomik-serviceutbud (t.ex. helgenom- eller genpanelsekvensering), med sekvensering framförallt på Illumina-plattformen (t.ex. på NovaSeq 6000).
• göra projektspecifika kostnadsberäkningar för serviceprojekt baserat på etablerade mallar
• kundkontakt i samband med provinlämning inför kvalitetskontroll, bibliotekspreparation och sekvensering
• delta i laborativt utvecklingsarbete av nya analysmetoder, t.ex. för analys av cell-fritt tumör-DNA (ctDNA)
• dokumentera och effektivisera arbetsflöden
• diverse administrativa göromål, t.ex. beställning av reagenser och laboratorietillbehör

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

• Examen inom adekvat grundutbildning från universitet eller högskola, t.ex. kandidatexamen som biomedicinsk analytiker eller magisterexamen i molekylärbiologi, biomedicin eller motsvarande
• > 2 års dokumenterad praktisk erfarenhet inom molekylärbiologiskt arbete (t.ex. extraktion av DNA/RNA, PCR-baserade metoder, Sangersekvensering och/eller NGS)
• Mycket god förståelse för och/eller tidigare praktisk erfarenhet av preparation av NGS-bibliotek
• Mycket god förståelse för och/eller tidigare praktisk erfarenhet av sekvensering av NGS-bibliotek på Illumina-plattformen
• Utmärkt förmåga att snabbt sätta sig in i nya metoder och etablera nya protokoll
• Utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på engelska

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet. Arbetsuppgifterna kräver att du är strukturerad och har en utmärkt förmåga att prioritera i arbetet. Arbetet sker teambaserat – såväl internt som externt - och kräver därför mycket god kommunikations- och samarbetsförmåga. Dessutom behöver du ha förmågan att arbeta självständigt. Vi söker dig som har ett prestigelöst och serviceinriktat arbetssätt.

Meriterinade för tjänsten är:

• PhD inom adekvat forskningsområde (t.ex. genomik eller genetik)
• > 2 års praktisk erfarenhet av metoder baserade på NGS (bibliotekspreparation och/eller sekvensering)
• Erfarenhet av arbete med vätskehanteringssystem för automatisering av laboratoriemetoder
• Erfarenhet inom ”single cell”-sekvensering (t.ex. baserat på 10X Genomics-plattformen) och/eller vävnadsbaserad analys
• Utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på svenska

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis.

Övrigt
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.