BMA/Laboratorie-/Forskningsingenjör till single cell-plattformen vid CTG - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Forskargruppen
Centrum för Translationell Genomik (CTG) är en prioriterad forskningsinfrastruktur vid Medicinska fakulteteten, Lunds universitet, som ingår i Clinical Genomics-plattformen inom SciLifeLab. Denna syftar bl.a. till att erbjuda translationella och kliniska forskare tillgång till toppmoderna analysmetoder inom genomik och transkriptomik (t.ex. WGS, RNA-seq och nya singelcell-analyser) samt till att snabbt omsätta nya forskningsfynd till klinisk nytta i nära samarbete med hälso- och sjukvården. Lokalt sker detta i tät samverkan med Sektionen för Molekylär Diagnostik vid Region Skåne. Inom CTG finns stor expertis inom den Nya Generationens Sekvenseringsteknologi (NGS), bioinformatik och en rad olika sjukdomsområden, och sett både i ett nationellt och internationellt perspektiv ligger enheten i teknisk framkant med tillgång till mycket kraftfulla sekvenseringsinstrument (t.ex. Illumina NovaSeq 6000). För databearbetning använder centrat ett dedikerat beräkningskluster vid Lunds Universitet.

Som en del i sitt nationella uppdrag ingår CTG och Clinical Genomics Lund även i ett nationellt samarbete för precisionsmedicin; Genomic Medicine Sweden, där utveckling av nya metoder för morgondagens forskning och diagnostik till stor del samordnas med motsvarande sekvenseringsenheter vid landets övriga universitetssjukhus.

Vi söker nu en driven, nyfiken och noggrann laboratoriemedarbetare som vill bidra till att stärka frontlinjeforskning baserad på avancerade genomiska analysmetoder. Anställningen är en tillsvidareanställning (100%) med önskat startdatum den 1 januari eller enligt överenskommelse. Provanställning om 6 månader kan komma att tillämpas. 

Arbetsuppgifter
Du kommer att ingå i ett team av drygt 5 laboratoriemedarbetare, inom vilket du framför allt kommer att fokusera på service till forskningsprojekt i behov av olika typer av singelscell-analyser (f.n. 10X Genomics- och Takara iCell8cx-baserat). Utöver laboratoriearbete innefattar tjänsten till stor del även kundkontakt och administrativa arbetsuppgifter (se nedan).

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är:

• projektplanering och praktiskt utförande av förekommande metoder inom CTG:s singelcell-serviceutbud (t.ex. mRNA, CITE-seq, ATAC-seq). Det praktiska utförandet innefattar även provmottagning, preparation och poolning av NGS-bibliotek och sekvensering framför allt på Illumina-plattformen.
• göra projektspecifika kostnadsberäkningar för serviceprojekt baserat på etablerade mallar
• kundkontakt och rådgivning i samband med serviceprojekt
• delta i laborativt utvecklingsarbete av nya singelcell-baserade analysmetoder
• dokumentera och effektivisera arbetsflöden
• diverse administrativa göromål, t.ex. beställning av reagenser och laboratorietillbehör

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

• Examen inom adekvat grundutbildning från universitet eller högskola, t.ex. kandidatexamen som biomedicinsk analytiker eller magisterexamen i molekylärbiologi, biomedicin eller motsvarande
• > 2 års dokumenterad praktisk erfarenhet inom molekylärbiologiskt arbete (t.ex. extraktion av DNA/RNA, PCR-baserade metoder, Sangersekvensering och/eller NGS)
• Erfarenhet av preparation av NGS-bibliotek
• Erfarenhet av sekvensering av NGS-bibliotek på Illumina-plattformen
• Mycket god förmåga att sätta sig in i olika typer av vetenskapliga frågeställningar och att diskutera dessa med forskare, t.ex. rörande behov av service eller utveckling av nya metoder
• Utmärkt förmåga att snabbt sätta sig in i nya metoder och etablera nya protokoll
• Utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på engelska

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet. Arbetsuppgifterna kräver att du är strukturerad och har en utmärkt förmåga att prioritera i arbetet. Arbetet sker mycket teambaserat – såväl internt som externt - och kräver därför mycket god kommunikations- och samarbetsförmåga. Dessutom behöver du ha förmågan att arbeta självständigt. Vi söker dig som har ett prestigelöst och serviceinriktat arbetssätt.

Meriterinade för tjänsten är:

• Doktorsutbildning inom adekvat forskningsområde (t.ex. genomik)
• > 1 års praktisk erfarenhet av singelcell-sekvensering (t.ex. 10X Genomics, SmartSeq2, Takara iCell8cx) och/eller relevanta vävnadsbaserade analyser
• > 2 års erfarenhet av metoder baserade på NGS (bibliotekspreparation och/eller sekvensering)
• Erfarenhet inom ett eller flera av områdena cellodling, fixering av vävnad och celler, samt mikroskopering (t.ex FISH eller RNA-scope)
• Utmärkt förmåga till muntlig och skriftlig kommunikation på svenska

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis.

Övrigt
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.