Bioinformatiker i klinisk genetik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av arbetsplatsen

Till Avdelningen för klinisk genetik och till forskargruppen ledd av professor Thoas Fioretos söker vi en bioinformatiker med inriktning mot matematisk modellering och maskininlärning. Inom forskargruppen, som består av ett 10-tal personer, arbetar vi bl.a. med integrativa genomiska analyser av leukemiceller för att bättre förstå varför dessa sjukdomar uppstår och för att förbättra diagnostik och uppföljning av patienter som insjuknar i leukemi. De integrativa genetiska analyserna består av helgenomsekvensering, exomsekvensering, RNA-sekvensering och singel-cell sekvensering av leukemiceller och ställer stora krav på kunskaper inom avancerad bioinformatisk och matematisk analys, samt maskininlärning. Läs mer om gruppens forskning här.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med högt i tak och omtanke om varandra.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Den anställda kommer att arbeta i ett team av forskare med både bioinformatisk och molekylärgenetisk kompetens och ha särskilt ansvar för att stödja utvecklingen och kunskapen avseende maskininlärning inom forskargruppen. Utvecklade klassningsverktyg kommer bl.a. att användas för att prediktera biologiska/genetiska undergrupper av olika leukemiformer. Den anställda förväntas också att vara behjälplig med programmering för utveckling av nya analysverktyg som underlättar tolkningen av erhållna datamängder.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• PhD inom matematik, gärna med fokus på matematisk modellering och bioinformatik
• Postdoktoral erfarenhet inom relevant ämnesområde (t.ex matematik, beräkningsbiologi)
• Mycket goda kunskaper inom maskininlärning (t.ex. XGBoost, Random forests)
• Ha tidigare kunskaper och erfarenhet av matematisk modellering och bioinformatiska analyser av stora genomiska datamängder
• Mycket goda kunskaper i programmering (t.ex. C++, Julia, Python, Perl och/eller R)

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du har förmågan att samarbeta väl med andra, eftersom du kommer att ingå i ett team, samt har en god förmåga att arbeta självständigt och tar egna initiativ.

Meriterande är:

•  Tidigare erfarenhet av att analysera genomiska data från blodcancer

Övrigt

Anställningen är en tillsvidareanställning på deltid (20%) med tillsättning den 1 september 2023. Provanställning på 6 månader kan komma att tillämpas.

Så här söker du:

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller kvalifikationskraven samt varför du är intresserad av anställningen. Ansökan ska även innehålla CV, inklusive publikationslista, en generell beskrivning av tidigare forskningsarbete, kopia av doktorsexamen samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av examensbevis, betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)