Projektassistent i biologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Arbetsuppgifter

Jämförande connectomics är en ny metod för att förstå evolution av neurala kretsar. Vi tillämpar denna metod på utvecklingen av insekters navigations-kretsar inom ramen för det ERC-finansierade projektet EvolvingCircuits. I detta projekt har vi utvecklat autosegmenteringsprotokoll med hjälp av maskininlärningsalgoritmer som översätter rå bild-data från volymelektronmikroskopi till segmenterade bildstaplar. Eftersom dessa automatiskt genererade neuronmorfologier innehåller många fel och är kraftigt fragmenterade, är manuell korrekturläsning en viktig men mödosam del av projektet.
Vi behöver därför en erfaren assistent, som kommer att hjälpa annoteringen av våra volymelektronmikroskopidata, genom att sätta ihop och korrigera automatiskt genererade neurala fragment till fullständiga neuronmorfologier.
Detta kommer att utföras över flera insektsarter och bildvolymer och kommer att utföras via fleranvändarprogramvaran FlyWire. Ytterligare manuell spårning av neuroner kommer att krävas regelbundet och kommer att utföras i programvaran CATMAID.

Kravprofil

• Kandidatexamen inom relevant område
* Minst 6 månaders erfarenhet av connectomics dataanalys (med programvaran
CATMAID och FlyWire)
• Intresse för insekters neuroanatomi och den neurala grunden för beteende
• Tålmodighet med utmärkt rumslig förståelse
• Initiativförmåga och förmåga att arbeta självständigt och i ett team
• Utmärkt kommunikationsförmåga i engelska, i både tal och skrift.
• Bakgrund inom neurobiology eller psychologi/cognitive science 

Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet. Hänsyn kommer att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka det administrativa arbetet inom avdelningen/institutionen.

Villkor
Heltidsanställning, start 1 februari 2024, tillsvidare

Kontaktperson: Stanley Heinze: stanley.heinze@biol.lu.se

Instruktioner för ansökan

Ansökan bör innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan bör även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).