Beskrivning av arbetsplatsen

Forskningen vid avdelningen för bioteknik och teknisk mikrobiologi bedrivs på både grundläggande och tillämpad nivå inom området bioteknik, med fokus på mikrobiell fysiologi, precisionsfermentering, syntetisk biologi, bioinformatik, enzymer och enzymatiska processer. Syftet med forskningen är ofta sammankopplat med utveckling av teknik för att skapa hållbara och cirkulära lösningar för produkter och tjänster med tillämpningar inom miljö, analys, livsmedel, vatten, jordbruk, medicin och industriell bioteknik för framställning av material, kemikalier och bränslen.

Avdelningen deltar aktivt i undervisningen på grundnivå inom LTH, framförallt på flera civilingenjörsprogram och internationella mastersprogram.

Ämnesbeskrivning

Biotekniken spelar en central roll i omställningen till ett hållbart samhälle. I doktorandprogrammet i bioteknik utvecklas och används levande organismer eller deras komponenter för att uppnå tekniskt användbara mål med hjälp av miljömässigt hållbara metoder. Med detta mål i åtanke fokuserar forskningen i detta doktorandprojekt på: 

1. Integrera molekylära data på olika nivåer för att bygga in-silico-modeller av järnmetabolism i enkla och komplexa organismer.
2. Använda stora datamängder genererade från 'omics'-studier för att härleda biologiskt meningsfulla tolkningar angående järntranslokation och metabolism.
3. Använda modeller och nätverk för att integrera gener, metaboliter, proteiner, regulatoriska element och andra biologiska komponenter som är relevanta för järnmetabolism.
4. Bygga prediktiva modeller som representerar metabolismen och translokationen av järn.
5. Identifiera biologiska mål för att öka den biotillgängliga järnhalten i rötter och blad hos rotlagrande växter.

Arbetsuppgifter

Huvuduppgiften för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan det även ingå/ingår det även medverkan i undervisning och annat institutionsarbete, dock max 20 % av arbetstiden.

Som en del av denna tjänst kommer dina uppgifter att inkludera att designa och utveckla kvantitativa och beräkningsmodeller för järnmetabolism och translokation i både enkla och komplexa organismer som mikroorganismer och rotlagrande växter.

Arbetsuppgifterna innefattar:

• Granska litteratur, analysera data och identifiera luckor till prediktiva matematiska modeller för järntranslokationsmekanismer.
• Samla in och analysera storskaliga datamängder med hjälp av beräkningsverktyg för att hitta mönster och interaktioner i metabolismen av järn i mikroorganismer och växter.
• Utveckling av matematiska och beräkningsmodeller för järnmetabolism och translokation, som senare kommer att valideras med experimentella data.
• Samarbeta med forskare från olika discipliner för en omfattande förståelse av järnmetabolism.
• Kommunicera och publicera resultat i tidskrifter, konferenser och vetenskapliga diskussioner.

Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har

• avlagt examen på avancerad nivå eller 
• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Kraven på särskild behörighet för systembiologi  uppfyller den som har: 

• minst 30 högskolepoäng inom huvudområdet biovetenskap, varav minst 15 högskolepoäng på avancerad nivå, samt ett fördjupningsarbete om minst 30 högskolepoäng på avancerad nivå inom ämnesområdet, eller
• civilingenjörsexamen eller motsvarande examen på avancerad nivå, inklusive inslag av tillämpad biovetenskap.
• minst 30 högskolepoäng inom ämnesområdet livsvetenskaper, varav minst 15 högskolepoäng på avancerad nivå inom ämnesområdet, eller civilingenjörsexamen, masterexamen i bioteknik eller annan examen på jämförbar avancerad nivå med inslag av tillämpade livsvetenskaper.

Ytterligare krav:

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• En stark dokumenterad grund i matematik, datavetenskap, fysik och/eller statistik på kandidat- och/eller mastersnivå.

Bedömningsgrunder

Urval till utbildning på forskarnivå sker efter bedömd förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Bedömningen av förmågan sker främst utifrån studieresultaten på grundnivå och avancerad nivå. Följande beaktas:

1. Kunskaper och färdigheter relevanta för avhandlingsarbetet och utbildningsämnet.
2. Bedömd förmåga till självständigt arbete och förmåga att formulera och angripa vetenskapliga problem.
3. Förmåga till skriftlig och muntlig kommunikation.

Annan erfarenhet relevant för forskarutbildningen, t.ex. deltagande i FoU-projekt inom akademin eller industrin med erfarenhet av att bygga och testa in-silico-modeller av biologiska processer och signalvägar från stora genomskaliga dataset.

Övriga meriter:

• Stark grund i matematik eller fysik, med en bakgrund inom matematik, biologisk fysik eller systembiologi.
• Kunskaper i statistik och dataanalys, samt kompetens i Python, och/eller C++ och/eller R.
• Demonstrerad erfarenhet av att bygga biologiska in-silico-modeller, samt kunskap om neurala nätverk och maskininlärning.
• Erfarenhet av att arbeta med forskningsprojekt som involverar konstruktion av in-silico biologiska modeller är fördelaktigt.
• Förmåga att kritiskt granska litteratur.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms ha den förmåga som behövs för att klara forskarutbildningen.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Komplettera gärna med ev. ytterligare fördelar. Läs mer på universitets webbplats om att Jobba hos oss. https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss För internationella kandidater kan man läsa mer om hur det är att arbeta och bo i Sverige på hemsidan: https://sweden.se/  

Övrigt

Endast den som är antagen till forskarutbildning får anställas som doktorand. Forskarutbildningen är fyra år vid heltidsstudier. Vid undervisning och annat institutionsarbete förlängs anställningen i motsvarande grad, dock längst till 5 år (dvs. max 20 %). Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1-7 §§.

Så här söker du

Ansökan bör/ska skrivas på engelska. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt forskningsprojektet matchar dina intressen och din utbildningsbakgrund. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).

Välkommen med din ansökan!

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.