Bioinformatiker inom interaktioner mellan fager och bakterier

Beskrivning av arbetsplatsen

Professor Vasili Hauryliuk är forskargruppsledare för gruppen för Molekylär Enzymologi vid Institutionen för Experimentell Medicinsk Vetenskap vid Lunds universitet. Hans forskargrupp arbetar med att struktur- och funktionskarakterisera de molekylära mekanismerna bakom bakteriellt antifageförsvarssystem.

Projektbeskrivning

Bakterier angrips ständigt av virus, bakteriofager. För att motstå dessa angrepp använder bakterier många olika antifageförsvarssystem, där det mest kända är CRISPR-Cas. I vårt laboratorium upptäcker vi nya system med hjälp av bioinformatik, validerar dem i mikrobiologiska tester och karaktäriserar sedan försvarsmekanismerna på molekylär nivå.

I detta projekt du ska genomföra en storskalig kartläggning av antifagförsvarssystem som är kodade i bakteriella genom. I samarbete med experimentalister i Hauryliuk-labbet kommer vi att testa de bioinformatiska upptäckterna experimentellt.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss, Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

En anställning som bioinformatiker är tänkt som ett inledande steg i karriären och som en möjlighet att ytterligare fördjupa och bredda forskningskompetens. Dina arbetsuppgifter kommer att vara bioinformatisk kartläggning och klassificering av antiphagförsvar som är kodade i bakteriella genom, utveckling och underhåll av webbaserade portaler som presenterar resultaten av dina analyser, samt samarbete med experimentalister som kommer att testa dina prediktioner i laboratoriet.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• Kandidat- eller magisterexamen inom teknisk eller naturvetenskaplig inriktning, såsom ingenjörsutbildning eller inom bioinformatik.
• Kompetens inom de nyckelapproacher som ska användas i detta tvärvetenskapliga projekt:

i) mycket goda kunskaper i programmering i Python,

ii) mycket goda kunskaper i design och implementation av webbaserat gränssnitt med kösystem samt

iii) mycket god kännedom om den svenska nationella beräkningsinfrastrukturen.

• En publikationshistorik i internationella tidskrifter.
• Kunskap om fagbiologi, med särskilt fokus på antiphagförsvarssystem
• Behärskning av talad och skriven engelska.
• Stor vikt kommer läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du är både strukturerad i ditt arbete och självgående.

Meriterande för anställningen är:

• Förtrogenhet med experimentella tekniker såsom molekylär kloning, fagisolering och tester av antiphagförsvar.

Övrigt

Anställningen är en särskild visstidsanställning under ett år på 100% med önskat tillträde 2026-05-01 eller enligt överenskommelse. 

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).

Mer information om Medicinska fakulteten