Postdoktor i multimodal analys av flytande biopsier (extracellulära vesiklar, ToF-SIMS/MALDI och maskininlärning)

Beskrivning av arbetsplatsen

Vid Medicinska fakulteten, Lunds universitet, kommer den framgångsrika kandidaten att ingå i en starkt tvärvetenskaplig forskningsmiljö i gränslandet mellan translationell cancerbiologi, analytisk kemi, evolution och datavetenskap. Arbetsplatsen erbjuder tillgång till moderna core-faciliteter för avancerad mikroskopi och cytometri, cell- och molekylärbiologi, analys av extracellulära vesiklar (EV) samt masspektrometri, och har starka samarbeten inom universitetet och med den regionala hälso- och sjukvården. Postdoktorn kommer att vara en del av ett internationellt team med aktiv seminariekultur och möjligheter att samhandleda studenter, bidra till undervisning samt delta i arbete med ansökningar och manuskript. Tjänsten är placerad i Lund med närhet till stora nationella forskningsinfrastrukturer och ett levande vetenskapligt nätverk.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra, och strävar efter en arbetsplats som upplevs som utvecklande och stimulerande för alla medarbetare. Vi arbetar ständigt med att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare. Vi värnar både om den fysiska säkerheten och psykosociala arbetsmiljön.

Projektbeskrivning

Projektet syftar till att utveckla nästa generations multimodala strategier för flytande biopsi och kemisk avbildning för biomarköridentifiering och mekanistisk förståelse av kemiska signaturer vid cancer och relaterade sjukdomar. Genom att kombinera robust isolering och fenotypning av extracellulära vesiklar (EV) med kemisk profilering via time-of-flight-masspektrometri (ToF-SIMS och MALDI-ToF) genereras integrerade molekylära signaturer som kan översättas till robusta monitoreringsanalyser av cancercellers proliferation och adaptation. Postdoktorn kommer att leda utvecklingen av högfidelitetsarbetsflöden för EV (från plasma och cellmodeller) och etablera kvantitativa analyser baserade på nanopartikel- och flödescytometri, kompletterat med masspektrometribaserad kemisk profilering och maskininlärningsstödd multivariat analys. Vid behov används genetiska perturbationer (CRISPR-Cas) i mammala cellmodeller för att validera kandidatvägar och biomarkörer.

Centrala leverabler inkluderar: (i) optimerade och benchmarkade EV-isolerings- eller karakteriseringspipelines; (ii) validerade ToF-SIMS/MALDI-analysmetoder och provberedningsstrategier; (iii) tolkbara multivariata eller ML-modeller för klassificering och identifiering av relevanta features; samt (iv) publikationer med hög genomslagskraft och öppna, återanvändbara analysarbetsflöden.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Vid Lunds universitet ska en anställning som postdoktor ge möjlighet till vetenskaplig och pedagogisk meritering. I första hand ges utrymme för meritering inom forskning, men även till viss högskolepedagogisk utbildning. Undervisning kan även ingå i arbetsuppgifterna.

Den postdoktorala forskaren förväntas ta en ledande roll i att designa, genomföra och kommunicera forskning på en nivå som sätter internationell standard.

Arbetsuppgifterna omfattar bland annat:

• Självständig planering och genomförande av experimentellt arbete i humana cellkulturer och relevanta provtyper nära patient (t.ex. plasma-deriverade EV).
• Utveckling, optimering och kvalitetskontroll av arbetsflöden för isolering och karakterisering av extracellulära vesiklar, inklusive kvantitativa och fenotypiska readouts.
• Avancerad metodutveckling och tillämpning inom ToF-SIMS och MALDI-ToF, inklusive provberedning och tolkning av data.
• Implementering av robust statistik och maskininlärningspipelines (t.ex. PCA, PLS-baserade metoder) för klassificering, biomarköridentifiering och integrering av data mellan plattformar.
• Validering av mekanistiska hypoteser med modern molekylärbiologi och genetisk ingenjörskonst (inklusive CRISPR-Cas-baserad genredigering) när projektet kräver det.
• Dokumentation av metoder och resultat för att säkerställa reproducerbarhet; författande av manuskript, konferensbidrag och ansöknings-/grant-liknande texter.
• Aktiv medverkan i forskningsmiljön, inklusive presentation av resultat, tvärvetenskapliga samarbeten och handledning/mentorskap av studenter och juniora forskare.
• Bidra till undervisning och pedagogisk meritering i linje med Lunds universitets ramverk för postdoktorer.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• Doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen inom analytisk kemi, biomedicin, molekylärmedicin, bioteknik, biofysik, bio-ingenjör eller närliggande tvärvetenskapligt område. Doktorsexamen ska vara avlagd senast vid tidpunkten då anställningsbeslut fattas.
• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Den framgångsrika kandidaten ska dessutom kunna uppvisa:

• Dokumenterad, praktisk kompetens som spänner över både (a) cell- och molekylärbiologi (t.ex. nukleinsyraextraktion, PCR/qPCR, immunfärgning, flödescytometri, Sanger seq, WB, DNA electrophoresis) och (b) avancerad analytisk kemi/masspektrometri (ToF-SIMS, MALDI-ToF, kolesterolextraktioner).
• Dokumenterad förmåga att utveckla och optimera komplexa experimentella arbetsflöden, inklusive stringenta kontroller, metodvalidering och felsökning i biologiska prover med hög variation.
• Stark kvantitativ kompetens och programmeringserfarenhet (Python och/eller R/Matlab) för reproducerbar databearbetning, statistik och multivariat analys av högdimensionella dataset.
• En mycket god publikationsmerit i relation till karriärstadium, med tecken på vetenskaplig självständighet, intellektuellt ledarskap och tydlig riktning mot bidrag med hög genomslagskraft.

Meriterande för anställningen är:

• Främst kommer den sökande i fråga som avlagt examen högst tre år före sista ansökningsdag.
• Tidigare forskning som förenar EV-/flytande biopsi-analys med masspektrometri och avbildningsdata, inklusive multivariat dataanalys för identifiering av relevanta features.
• Visad kompetens i nanopartikelbaserade analyser och/eller bead-assisterad flödescytometri för kvantifiering och fenotypning av EV.
• Erfarenhet av ToF-SIMS kemisk avbildning av celler, vävnader, funktionalisering av MALDI-target eller tunnfilms- och ytkemi relevant för utveckling av analytiska assays.
• Erfarenhet av provberedning/datainsamling för elektron-kryomikroskopi och/eller andra avancerade strukturella eller biofysiska metoder.
• Dokumenterad förmåga att kommunicera forskning, inklusive inbjudna föredrag, konferenspresentationer och bidrag till ansökningsskrivande.
• Dokumenterad pedagogisk erfarenhet, såsom handledning, kursstöd eller mentorskap av studenter i laboratorie- och dataanalysmiljöer.

Bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss; Jobba hos oss.

Om anställningen

Anställningen är en visstidsanställning på två, 100%, med startdatum den 1 april 2026 eller enligt överenskommelse. Anställningar vid Lunds universitet bedrivs i Sverige; du förväntas därför kunna utföra ditt arbete på plats i Lund (eller annan överenskommen plats inom universitetets verksamhet i Sverige).

Anställningen är tidsbegränsad till minst två år, max tre år, enligt kollektivavtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor (arbetsgivarverket). En anställning som postdoktor är tänkt som ett inledande steg i karriären och som en möjlighet att ytterligare fördjupa och bredda forskningskompetens.

Övrigt

Tjänsten erbjuder goda möjligheter till professionell utveckling, inklusive tillgång till pedagogisk utbildning, stöd för karriärutveckling samt ett aktivt internationellt nätverk. Postdoktoranden förväntas arbeta på plats i Lund och bidra till en inkluderande, samarbetsinriktad och högpresterande forskningskultur.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan bör innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla, examensbevis, CV eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.).

Mer information om Medicinska fakulteten