Forskare i genuttryckets roll för ny variation från hybrisering - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Ämnesbeskrivning
Vi rekryterar en forskare till en tjänst för projektet ”Hybridization derived novel patterns of gene expression”. Projektet syftar till att undersöka hur nya mönster av genuttryck kan uppstå genom hybridisering och möjliggöra anpassning. Två specifika frågor som kommer att undersökas är 1) i vilken utsträckning alternative splicing bidrar till ändrade transkriptionsprofiler i hybridarten Italiensk sparv Passer italiae jämfört med dess föräldraarter, samt 2) hur microRNA bidrar till ändrad reglering av genuttryck i den Italienska sparven, med fokus på bl a dess reglering av uttryck av transposabla element. Forskaren kommer att utföra analyser av genuttryck, hjälpa till att designa provtagning för genuttrycksanalys och bidra till att förbättra referensgenom samt till fältarbetet. En viktig komponent är också att tolka resultaten i en evolutionär och ekologisk kontext. Forskaren kommer att jobba med HybridExpress teamet som består av en lab manager, en doktorand och möjligen en eller flera post docs. Projektet leds av biträdande universitetslektor Anna Runemark, och är baserat i gruppen SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen på biodiversitetsenheten. 

Arbetsuppgifter 
Den huvudsakliga arbetsuppgiften består i att utföra forskning, primärt bioinformatisk analys av RNA-seq data med fokus på alternative splicing och micro RNA, och därutöver bidra till planering av provtagning för genuttryck och bidra till fältarbetet. Utöver bioinformatisk analys av uttrycksskillnader mellan gener med fokus på alternative splicing och microRNA, kommer forskaren att jobba med att förbättra referensgenomen, utveckla repeterbara pipelines, utveckla evolutionär teori baserat på resultaten, samt syntetisera arbetet för publicering. Forskaren förväntas aktivt delta i aktiviteterna i gruppen SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen på biodiversitetsenheten, samarbeten och bidra med mentorskap för studenter i labbet. Forskaren kommer att jobba med HybridExpress teamet som består av en lab manager, en doktorand och möjligen en eller flera post docs. Det kommer att finnas goda möjligheter att utveckla självständiga projekt och att söka forskningsmedel för dessa.

Krav för anställningen

• Avlagd doktorsexamen inom evolutionärbiologi, evolutionär ekologi, genetik eller liknande
• Dokumenterad förmåga att utföra forskning av hög kvalitet
• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Dokumenterade kunskaper inom evolutionärgenomik med expertis inom genuttryckets roll i anpassning

Meriterande för anställningen
Positionen är avsedd för karriärutveckling, med fokus på forskning. De huvudsakliga utvärderingskriterierna är:

• Mycket goda kunskaper i bioinformatisk analys och tolkning av genuttrycksdata
• Kunskap i att analysera alternative splicing och förståelse av dess roll i evolutionär anpassning
• Kunskaper i assembly och annotering av referensgenom
• En god förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet

Ytterligare meriterande kunskaper

• Erfarenhet av att designa repeterbara pipelines för bioinformatisk analys
• Bakgrund i evolutionärbiology, evolutionär ekologi eller evolutionärgenomik dokumenterad genom publikationer

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor mm
Anställningen är tillsvidare på heltid med tillträde 2023-06-01 eller enligt överenskommelse. Kontakta gärna Anna Runemark (anna.runemark@biol.lu.se) om du har frågor.

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista.
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max två sidor).
• Kontaktuppgifter till minst två referenser.
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen.