Systemingenjör vid LUDC - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av arbetsplatsen

Lund University Diabetes Centre (LUDC; www.ludc.med.lu.se) utlyser härmed en tjänst som systemingenjör. LUDC är ett av världens största diabetescentrum med cirka 300 anställda (forskare och övrig personal) som arbetar för att förebygga diabetes samt förbättra diagnostik och behandling av diabetes. För att nå dessa mål arbetar vi vid centret för att kombinera expertis inom genetik, epidemiologi, bioinformatik, molekylär- och cellbiologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi. LUDC har stora unika biobanker och databaser med helgenomsdata länkade till nationella register med data om sjukdomsuppkomst och -förlopp, samt till register med data om behandling och behandlingsrespons. Centret har egna plattformar för de flesta molekylära genetiska metoderna och metabolomik. Tack vare Omics-information kombinerat med utförliga fenotypdata kan vi använda oss av ”systems medicine” för att förstå komplexiteten av diabetes. Ett viktigt mål för LUDC är att utveckla individanpassad behandling för att förbättra hälsan och livskvaliteten för patienter med diabetes.

Vi erbjuder

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmånder, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet Jobba hos oss.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Den sökande som anställs kommer att ingå i enheten för bioinformatik vid LUDC, som innefattar flera bioinformatiker, en biostatistiker, en data manager och ytterligare en systemingenjör (https://www.ludc.lu.se/resources/ludc-bioinformatics-unit). Enheten tillhandahåller bioinformatik, biostatistik och computational support till alla som är anslutna till LUDC, samt tillgång till en datormiljö med hög prestanda.

Den systemingenjör som anställs kommer att primärt, tillsammans med vår befintliga systemingenjör, hjälpa till att driva vår Linuxbaserade server- och HPC-miljö för LUDC. Utöver denna skötsel och den dagliga driften, kommer den sökande att vara involverad i diverse projekt och förväntas kunna ge stöd till de forskargrupper som finns på LUDC vid behov. Arbetsuppgifter kan t.ex. inkludera:

• Bearbetning/konvertering av data.
• Enklare scripts eller program.
• Design, implementering och drift av hela studier, både nationella och internationella.
• Hantering av big data, ofta känsliga sådana.
• Inköp av hårdvara.
• Lösningar för att dela data/resurser med externa samarbetspartners.

Detta kräver stort engagemang, fokus samt vilja att ta till dig ny kunskap då det kan handla om komplexa lösningar, ofta med givna tidsramar och krav på kvalitet. Stor vikt läggs vid personliga egenskaper såsom samarbets- och initiativförmåga, ett noggrant arbetssätt och flexibilitet.

Kvalifikationer:

• Kandidatexamen inom relevant ämnesområdet för jobbet och lämplig arbetslivserfarenhet.
• Mycket god erfarenhet av installation, konfiguration och drift av Linuxbaserade OS, främst RHEL och kloner därav såsom Rocky, Alma och Centos.
• Kunskap om hur man bygger och installerar mjukvara både som paket och via kompilering.
• Vana vid att följa, läsa och åtgärda saker utifrån information i loggar och systemmeddelanden.
• God förståelse för säker hantering av data över digitala plattformar. Känna till kraven för persondata, biologiska/medicinska data och vad GDPR innebär för känsliga persondata.
• God kunskap och erfarenhet av att dokumentera ditt arbete, både på en teknisk nivå och på en pedagogisk nivå, på svenska och engelska.
• Mycket god erfarenhet av att kunna jobba främst i bash, men ett plus om du har kunskap om andra vanliga scriptspråk.
• God erfarenhet av deployment, drift, administration och uppdateringar av servrar på hårdvarunivå. (Firmware-uppdateringar och out-of-band-konfiguration såsom iDRAC).
• Kunskap om Linux filsystem generellt, POSIX ACL:er, rättigheter och säkerhet.
• Erfarenhet av arbete med nätverkskonfiguration av TCP/IP och brandväggar (iptables, firewalld).
• Tidigare erfarenhet av att konfigurera, sätta upp och driva miljö med virtuella maskiner i KVM.
• Dokumenterad muntlig och skriftlig färdighet i engelska.

Meriterande för anställningen är:

Erfarenhet av:

• HPC/kluster och HTCondor
• Kontohantering via openLDAP-lösningar är ett starkt plus.
• IBM Spectrum Scale, GPFS (konfiguration, drift och övervakning).
• IBM Spectrum Protect (konfiguration, drift och övervakning).
• Scriptspråk såsom PHP, Python, Perl samt kunskap att ge användare support vid behov.
• SQL och databaser såsom postgresql, sqlite, oracleDB med flera.
• Containers (Docker, Singularity).
• Repositories - Github etc.
• SAN-lösningar.
• Load Balancing, heartbeat och andra redundans-lösningar.
• R
• Bearbetning och konvertering av medicinska/biologiska data.
• HTML, JS, CSS och webdesign/weblösningar

Övrigt

Sökanden inbjuds att ansöka om en tillsvidareanställning på heltid (100 %) som systemingenjör vid LUDC. Anställningen inleds med sex månaders provanställning. Preliminärt startdatum är 2023-04-01 eller enligt överenskommelse.

Så här söker du

Ansökan ska innehålla ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska/bör även innehålla CV och kontaktuppgifter till 3 referenser.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1 800 anställda och 2 700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för kliniska vetenskaper i Malmö är en av de sex institutionerna vid Lunds universitets medicinska fakultet. Vi har ett starkt fokus på klinisk och epidemiologisk forskning, och bedriver även omfattande preklinisk laboratorieforskning.