Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Forskargruppen

Vid forskargrupperna för Cell, Tissue and Organ engineering och Human Neural Development bedrivs forskning inom cellulär heterogenitet i stamcells-härledda vävnader, för både grundläggande och translationella användningsområden. Forskningen har sedan flera år legat i framkant inom våra 2 områden: miniatyriserade benorgan som återskapar ben- och blodfunktionerna hos människor samt stamceller för att studera den mänskliga hjärnans utveckling och neurala subtyper. Forskargrupperna leds av Paul Bourgine och Agnete Kirkeby och består av både forskande och teknisk personal. Verksamheten är lokaliserad på Biomedicinskt centrum i Lund. Här kan du läsa mer om vår spännande forskning.( www.bourginelab.com, https://www.wcmm.lu.se/research/wcmm-researchers, https://in.ku.dk/research/agnete-kirkeby/)

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi söker härmed en driven biträdande forskare för arbete med bioinformatisk single cell-RNAseq (scRNAseq)-analys från mänskliga skelett- och nervceller under utveckling. Anställningen är visstidsanställning på heltid 1 år och 10 månader med önskat tillträdesdatum den 2021-03-15 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

Som bitr forskare inom våra två forskargrupper ansvarar du för bioinformatisk single cell-RNAseq (scRNAseq)-analys från mänskliga skelett- och nervceller under utveckling. I dina arbetsuppgifter ingår huvudsakligen analys av scRNAseq-data från rå sekvensläsningar till kluster samt utveckling och integration av flera algoritmer (t.ex. SCENIC, SPRING, Pseudotime, RNA-velocity) för att studera cell- och vävnadssubtyp, cell differentiering- och mognad samt genomik, proteomik och transkriptomik. Även andra förekommande arbetsuppgifter inom forskargruppen kan bli aktuella.

Kravprofil

För anställningen krävs:

- Magisterexamen i bioinformatik, datavetenskap eller motsvarande områden

- Doktorsexamen i bioinformatik, biologi eller biomedicin.

- Erfarenhet från att arbeta med biologi- eller life science-projekt

- Erfarenhet av att arbeta med single cell-RNA-sekvenseringsdata, inklusive utveckling av algoritmer för automatiserad hierarkisk gruppering av celler

- Erfarenhet av vetenskaplig publicering, med flera uppsatser som första författare

- Bra kunskap i engelska, muntligt och skriftligt

-erfarenhet av att arbeta i team

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du är ambitiös och noggrann.

Meriterande för anställningen är:

- grundutbildning med blandade ämnen med en kandidatexamen i biologi / biomedicin / biovetenskap kombinerad med en kandidatexamen i bioinformatik / datavetenskap.- erfarenhet av många forskningsprojekt i olika grupper- erfarenhet av analys av proteinstrukturen är ett plus 

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis

Övrigt

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 210315
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Lund
Län Skåne län
Land Sverige
Referensnummer PA2021/478
Kontakt
  • Agnete Kirkeby, +46462220555
Facklig företrädare
  • OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-222 93 62
  • SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-222 93 64
  • SEKO: Seko Civil, 046-222 93 66
Publicerat 2021-02-19
Sista ansökningsdag 2021-03-05

Tillbaka till lediga jobb