Postdoktor i diabeteskomplikationer vid LUDC - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Beskrivning av arbetsplatsen

Lund University Diabetes Centre (LUDC; www.ludc.med.lu.se) är ett av världens största forskningscenter inom diabetes med ca 300 medarbetare, (inklusive forskare, teknisk och administrativ personal) som arbetar för förbättrad diagnostik, prevention och behandling av diabetes och dess följdsjukdomar. Centret kombinerar expertis inom genetik, epidemiologi, statistik, bioinformatik, molekylär och cellulär biologi, fysiologi och klinisk diabetes och endokrinologi för att nå dessa mål. LUDC har en stor samling biobanker och databaser med helgenomsdata länkat till nationella register med information rörande sjukdomsuppkomst och sjukdomsförlopp, såväl som länkat till register rörande behandling och respons på behandling. Centret har egna plattformar för de flesta molekylära genetiska metoder och metabolomik. Omics-information kombinerat med rika fenotypdata möjliggör att vi kan använda oss av ”systems medicine” för att undersöka komplexiteten av diabetes. En viktig del för LUDC är att utveckla individanpassad behandling för att förbättra hälsan och livskvaliteten för patienter med diabetes.

Forskningsområde

Forskningen kommer att bedrivas inom ramen för pågående EU-projekt BEAt-DKD (https://www.beat-dkd.eu/) och uppföljande mer nyligen beviljad PRIME-CKD (https://umcgresearch.org/w/umcg-lead-collaborations-to-advance-precision-medicine-in-chronic-kidney-disease). I dag lever ca 537 miljoner vuxna (20–79 år) med diabetes, dvs. en av tio, och detta antal förutspås stiga till 643 miljoner fram till år 2030 och 783 miljoner fram till år 2045. Detta kommer oundvikligen att resultera i ett ökat antal patienter med DKD, eftersom cirka 20–50 % av patienter med diabetes till slut utvecklar DKD. Globalt fortsätter DKD att vara den ledande orsaken till kronisk njursjukdom (CKD) och njursjukdom i slutskedet (ESRD), vilket även tar hänsyn till hög kardiovaskulär sjuklighet och dödlighet och minskad hälsorelaterad livskvalitet för patienter. Det övergripande syftet med projektet är att identifiera och validera nya prognostiska och

prediktiva biomarkörer som kan hjälpa oss identifiera vilka patienter som kommer att ha ett snabbare mer aggressivt sjukdomsförlopp, respektive vilka patienter som med högre sannolikhet kommer att svara eller ej på en specifik behandling. Projektet avser också att identifiera mekanismer och signalvägar som ligger bakom initiering och progression av CKD och som kan bli måltavlor för nya läkemedel. Forskningen bedrivs vid enheten för Diabetiska komplikationer som leds av professor Maria F. Gomez, som är koordinator för LUDC och BEAt-DKD.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Vi letar nu efter en entusiastisk och begåvad person för att stärka enhetens expertis inom datautvinning, artificiell intelligens, epidemiologi, folkhälsa och systems medicine inom ramen för precisionsmedicin. Vi förväntar oss att den framgångsrika sökanden har erfarenhet av programmering, dataanalys och datautvinning för att identifiera trender och producera betydelsefulla datavisualiseringar, samt erfarenhet av att arbeta med olika bioinformatikverktyg och statistiska metoder. Sökanden förväntas också ha utmärkt kommunikationsförmåga och en vilja att interagera med andra forskare.

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare än ovan nämnda tre år.

Bedömningsgrunder

Vid Lunds universitet ska en anställning som postdoktor ge möjlighet till vetenskaplig och pedagogisk meritering. I första handa ges utrymme för meritering inom forskning, men även till viss högskolepedagogisk utbildning. Undervisning kan även ingå i arbetsuppgifterna. Vid anställning som postdoktor kommer främst beaktas vetenskaplig förmåga.

Kvalifikationer

För anställningen krävs:

• PhD inom tjänstens ämnesområde (dvs. epidemiologi, folkhälsa eller annan närliggande disciplin), med bevisad erfarenhet när det gäller att tillämpa kvantitativa metoder för dataanalys samt erfarenhet av programmering.
• Erfarenhet med hantering, analys och annotering av mycket stora datauppsättningar, både utforskande och i form av pipelines.
• Erfarenhet av dataanalys och datautvinning för att identifiera trender och producera betydelsefulla datavisualiseringar, med kunskap om att bygga, utveckla och implementera interaktiva dashboards med hjälp av frameworks som R Shiny.
• Erfarenhet av att arbeta med olika bioinformatikverktyg och statistiska metoder.
• Färdighet i R och kunskap och erfarenhet från åtminstone ett annat relevant programmeringsspråk (t.ex. Python, Perl, Java). Kunskap i maskininlärningsalgoritmer och frameworks, deep learning-metoder för bildanalyser.
• Erfarenhet av att utveckla anpassade programmeringsverktyg och -funktioner, samt att arbeta med API:er för att komma åt och integrera data från olika källor.
• Erfarenhet av att arbeta med ostrukturerade data (såsom text) genom att använda datautvinning och/eller natural language processing (NLP)-tekniker.
• Erfarenhet av webbaserade bioinformationsverktyg och offentliga domändatabaser med biologiska och hälsorelaterade data.
• Stark förståelse av tekniker för prediktiv modellering och förmåga att tillämpa dem i real-world-situationer.
• Mycket kapabel att samarbeta i tvärvetenskapliga team, som kan inkludera laboratorieforskare, läkare, epidemiologer, bioinformatiker, statistiker och dataanalytiker.
• Vi kommer även att överväga personliga egenskaper där självmotiverade och flexibla individer, som klarar av att arbeta självständigt på ett väldokumenterat sätt, att hantera flera projekt parallellt och att prioritera och möta deadlines, kommer att prioriteras.
• Dokumenterad muntlig och skriftlig utmärkt färdighet i kommunikation på engelska.

Meriterande för anställningen är:

• Relevant forskningsbakgrund för projektets forskning och arbetsuppgifter, samt erfarenhet av diabetesforskning.
• Utmärkta kommunikationsegenskaper (både muntliga och skriftliga), som inkluderar muntliga föredrag och posterpresentationer.
• Erfarenhet av att arbeta i en internationell miljö.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till tre år och avser heltid. Preliminärt startdatum är 3 mars 2023, eller enligt överenskommelse. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, ”Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter (Arbetsgivarverket, OFR:s, SACO-S och SEKO) daterat 2021-11-19.

Instruktioner för ansökan

Du söker anställningen via Lund universitets rekryteringssystem Varbi.

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller de eftersökta kvalifikationerna, ett CV samt examensbevis.