Bioinformatiker till gruppen för RNA och stamcells biologi

Laboratoriet för RNA och stamcellbiologi är inbäddat i Lund Stem Cell Center, ett internationellt rankat forskningscenter inom de strategiska områdena stamcellbiologi och regenerativ medicin. Vår forskning fokuserar på nya post-transkriptionella aspekter av genuttryckskontroll i stam- och cancerceller på en molekylär, cellulär och organism-nivå. Specifikt är vi intresserade av den molekylära basen genom vilken RNA-modifieringar reglerar genuttryck under utveckling och i cancer.

Arbetsuppgifter

Vid anställning kommer du att vara direkt ansvarig för bioinformatikanalysen av de viktigaste pågående projekten i laboratoriet som centrerar rollen för RNA-modifierande enzymer i stam- och cancerceller. Specifikt förväntas du tillämpa olika bioinformatiska strukturer för: (1) karakterisera nya molekylära signaturer av små RNA i humana och murina hematopoietiska celler; (2) avslöja regleringsvägar som reglerar biogenes av små RNA: s mål för RNA-modifierande enzymer i stam- och cancerceller och; (3) studera effekterna av förändrade RNA-modifieringar för delning och översättning av genomet. Vid anställning förväntas du arbeta självständigt såväl som en del av ett forskarteam. Andra vanligt förekommande arbetsuppgifter i laboratoriet förekommer.

Kvalifikationer

Krav

• Du som sökande innehar en doktorsexamen inom medicin med inriktning bioinformatik.
• Tidigare erfarenhet av analys av olika RNA-sekvensbestämningssatser (RNA-seq) från mus- och mänskliga celler inklusive hela transkriptomsekvens, liten RNA-sekvens, polysome-sekvens, ribosomfotavtrycksprofil och iCLIP-seq.
• God kunskap om strukturer för mRNA-skarvningsanalys.
• Tidigare dokumenterat arbete inom forskningsakademiska grupper inom områdena RNA/cancerbiologi och hematologi behövs.
• Utmärkta muntliga och skriftliga kommunikationsfärdigheter i engelska krävs för tjänsten, vi ser med fördel att du skriver din ansökan på engelska.

Meriterande

• Tidigare erfarenhet av analys av DNA och RNA-epigenetik inklusive ChIP-seq, ATAC-seq, mRIP-seq och pseudo-seq är starkt meriterande.
• Du som söker bör ha kapacitet att förbättra etablerade modeller, protokoll och/eller utveckla nya metoder.  

Sökandes personliga lämplighet att arbeta inom vår forskningsmiljö kommer att beaktas.